Protein–RNA interactions for Protein: P51910

Apod, Apolipoprotein D, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApodP51910 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ApodP51910 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ApodP51910 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ApodP51910 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ApodP51910 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ApodP51910 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ApodP51910 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ApodP51910 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ApodP51910 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ApodP51910 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ApodP51910 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ApodP51910 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ApodP51910 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ApodP51910 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ApodP51910 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ApodP51910 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ApodP51910 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ApodP51910 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ApodP51910 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ApodP51910 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ApodP51910 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ApodP51910 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ApodP51910 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ApodP51910 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ApodP51910 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ApodP51910 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ApodP51910 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ApodP51910 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ApodP51910 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ApodP51910 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ApodP51910 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ApodP51910 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ApodP51910 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ApodP51910 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ApodP51910 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ApodP51910 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ApodP51910 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ApodP51910 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ApodP51910 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ApodP51910 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ApodP51910 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ApodP51910 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ApodP51910 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ApodP51910 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ApodP51910 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ApodP51910 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ApodP51910 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ApodP51910 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ApodP51910 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ApodP51910 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ApodP51910 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ApodP51910 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ApodP51910 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ApodP51910 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ApodP51910 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ApodP51910 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ApodP51910 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ApodP51910 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ApodP51910 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ApodP51910 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ApodP51910 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ApodP51910 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ApodP51910 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ApodP51910 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ApodP51910 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ApodP51910 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ApodP51910 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ApodP51910 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ApodP51910 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ApodP51910 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ApodP51910 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ApodP51910 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ApodP51910 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ApodP51910 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ApodP51910 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ApodP51910 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ApodP51910 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ApodP51910 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ApodP51910 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ApodP51910 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ApodP51910 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ApodP51910 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ApodP51910 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ApodP51910 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ApodP51910 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ApodP51910 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ApodP51910 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ApodP51910 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ApodP51910 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ApodP51910 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ApodP51910 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ApodP51910 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ApodP51910 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ApodP51910 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ApodP51910 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ApodP51910 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ApodP51910 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ApodP51910 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ApodP51910 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ApodP51910 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.1 ms