Protein–RNA interactions for Protein: P51530

DNA2, DNA replication ATP-dependent helicase/nuclease DNA2, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNA2P51530 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DNA2P51530 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
DNA2P51530 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
DNA2P51530 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
DNA2P51530 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
DNA2P51530 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
DNA2P51530 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
DNA2P51530 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
DNA2P51530 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
DNA2P51530 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
DNA2P51530 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
DNA2P51530 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DNA2P51530 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DNA2P51530 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
DNA2P51530 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
DNA2P51530 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
DNA2P51530 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
DNA2P51530 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
DNA2P51530 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
DNA2P51530 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
DNA2P51530 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
DNA2P51530 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
DNA2P51530 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
DNA2P51530 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DNA2P51530 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DNA2P51530 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DNA2P51530 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
DNA2P51530 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
DNA2P51530 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DNA2P51530 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DNA2P51530 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DNA2P51530 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
DNA2P51530 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
DNA2P51530 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
DNA2P51530 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
DNA2P51530 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
DNA2P51530 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
DNA2P51530 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
DNA2P51530 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
DNA2P51530 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
DNA2P51530 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
DNA2P51530 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
DNA2P51530 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
DNA2P51530 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
DNA2P51530 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
DNA2P51530 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
DNA2P51530 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
DNA2P51530 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
DNA2P51530 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
DNA2P51530 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
DNA2P51530 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
DNA2P51530 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
DNA2P51530 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
DNA2P51530 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
DNA2P51530 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
DNA2P51530 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
DNA2P51530 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
DNA2P51530 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
DNA2P51530 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
DNA2P51530 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
DNA2P51530 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
DNA2P51530 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
DNA2P51530 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
DNA2P51530 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
DNA2P51530 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
DNA2P51530 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
DNA2P51530 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
DNA2P51530 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
DNA2P51530 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
DNA2P51530 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
DNA2P51530 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
DNA2P51530 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
DNA2P51530 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
DNA2P51530 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DNA2P51530 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
DNA2P51530 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DNA2P51530 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
DNA2P51530 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
DNA2P51530 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
DNA2P51530 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
DNA2P51530 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
DNA2P51530 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
DNA2P51530 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DNA2P51530 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DNA2P51530 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
DNA2P51530 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DNA2P51530 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DNA2P51530 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
DNA2P51530 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DNA2P51530 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DNA2P51530 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DNA2P51530 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DNA2P51530 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DNA2P51530 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DNA2P51530 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DNA2P51530 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DNA2P51530 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
DNA2P51530 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
DNA2P51530 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
DNA2P51530 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms