Protein–RNA interactions for Protein: P51148

RAB5C, Ras-related protein Rab-5C, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5CP51148 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB5CP51148 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB5CP51148 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB5CP51148 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB5CP51148 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB5CP51148 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB5CP51148 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB5CP51148 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB5CP51148 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB5CP51148 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB5CP51148 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB5CP51148 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB5CP51148 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB5CP51148 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB5CP51148 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB5CP51148 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB5CP51148 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB5CP51148 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB5CP51148 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB5CP51148 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB5CP51148 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB5CP51148 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB5CP51148 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB5CP51148 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB5CP51148 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
RAB5CP51148 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB5CP51148 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB5CP51148 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB5CP51148 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB5CP51148 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB5CP51148 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB5CP51148 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB5CP51148 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB5CP51148 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB5CP51148 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB5CP51148 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB5CP51148 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB5CP51148 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB5CP51148 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB5CP51148 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB5CP51148 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB5CP51148 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB5CP51148 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB5CP51148 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB5CP51148 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB5CP51148 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB5CP51148 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB5CP51148 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB5CP51148 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB5CP51148 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB5CP51148 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB5CP51148 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB5CP51148 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB5CP51148 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB5CP51148 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB5CP51148 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB5CP51148 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB5CP51148 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB5CP51148 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB5CP51148 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB5CP51148 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB5CP51148 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RAB5CP51148 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
RAB5CP51148 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB5CP51148 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB5CP51148 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB5CP51148 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB5CP51148 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB5CP51148 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB5CP51148 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB5CP51148 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB5CP51148 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB5CP51148 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB5CP51148 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB5CP51148 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RAB5CP51148 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB5CP51148 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB5CP51148 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB5CP51148 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB5CP51148 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB5CP51148 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB5CP51148 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB5CP51148 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB5CP51148 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB5CP51148 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB5CP51148 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB5CP51148 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB5CP51148 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB5CP51148 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB5CP51148 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB5CP51148 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB5CP51148 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB5CP51148 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB5CP51148 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB5CP51148 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB5CP51148 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB5CP51148 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB5CP51148 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB5CP51148 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB5CP51148 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms