Protein–RNA interactions for Protein: P50993

ATP1A2, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A2P50993 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATP1A2P50993 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATP1A2P50993 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATP1A2P50993 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATP1A2P50993 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATP1A2P50993 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATP1A2P50993 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATP1A2P50993 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATP1A2P50993 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATP1A2P50993 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATP1A2P50993 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATP1A2P50993 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATP1A2P50993 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
ATP1A2P50993 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATP1A2P50993 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATP1A2P50993 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATP1A2P50993 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP1A2P50993 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP1A2P50993 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP1A2P50993 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP1A2P50993 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP1A2P50993 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP1A2P50993 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATP1A2P50993 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATP1A2P50993 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATP1A2P50993 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATP1A2P50993 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATP1A2P50993 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATP1A2P50993 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATP1A2P50993 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATP1A2P50993 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATP1A2P50993 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATP1A2P50993 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATP1A2P50993 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATP1A2P50993 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATP1A2P50993 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATP1A2P50993 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATP1A2P50993 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATP1A2P50993 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATP1A2P50993 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATP1A2P50993 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATP1A2P50993 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATP1A2P50993 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATP1A2P50993 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATP1A2P50993 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATP1A2P50993 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATP1A2P50993 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATP1A2P50993 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATP1A2P50993 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATP1A2P50993 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATP1A2P50993 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATP1A2P50993 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
ATP1A2P50993 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATP1A2P50993 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATP1A2P50993 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATP1A2P50993 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATP1A2P50993 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATP1A2P50993 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATP1A2P50993 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATP1A2P50993 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATP1A2P50993 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATP1A2P50993 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
ATP1A2P50993 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATP1A2P50993 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATP1A2P50993 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATP1A2P50993 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATP1A2P50993 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP1A2P50993 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP1A2P50993 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP1A2P50993 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP1A2P50993 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP1A2P50993 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP1A2P50993 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATP1A2P50993 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATP1A2P50993 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATP1A2P50993 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP1A2P50993 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATP1A2P50993 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATP1A2P50993 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP1A2P50993 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP1A2P50993 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP1A2P50993 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP1A2P50993 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP1A2P50993 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP1A2P50993 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP1A2P50993 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP1A2P50993 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATP1A2P50993 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ATP1A2P50993 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP1A2P50993 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATP1A2P50993 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP1A2P50993 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP1A2P50993 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP1A2P50993 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP1A2P50993 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP1A2P50993 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATP1A2P50993 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
ATP1A2P50993 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATP1A2P50993 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATP1A2P50993 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms