Protein–RNA interactions for Protein: P50747

HLCS, Biotin--protein ligase, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLCSP50747 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HLCSP50747 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HLCSP50747 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HLCSP50747 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HLCSP50747 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HLCSP50747 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HLCSP50747 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HLCSP50747 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HLCSP50747 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HLCSP50747 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HLCSP50747 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HLCSP50747 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HLCSP50747 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
HLCSP50747 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HLCSP50747 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HLCSP50747 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HLCSP50747 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HLCSP50747 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HLCSP50747 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HLCSP50747 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HLCSP50747 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HLCSP50747 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HLCSP50747 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HLCSP50747 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HLCSP50747 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HLCSP50747 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HLCSP50747 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HLCSP50747 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HLCSP50747 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HLCSP50747 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HLCSP50747 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HLCSP50747 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
HLCSP50747 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HLCSP50747 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HLCSP50747 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HLCSP50747 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HLCSP50747 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HLCSP50747 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HLCSP50747 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
HLCSP50747 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HLCSP50747 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
HLCSP50747 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
HLCSP50747 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
HLCSP50747 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HLCSP50747 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HLCSP50747 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HLCSP50747 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HLCSP50747 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HLCSP50747 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HLCSP50747 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HLCSP50747 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HLCSP50747 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HLCSP50747 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HLCSP50747 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HLCSP50747 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HLCSP50747 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HLCSP50747 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HLCSP50747 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HLCSP50747 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HLCSP50747 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
HLCSP50747 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HLCSP50747 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HLCSP50747 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HLCSP50747 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HLCSP50747 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HLCSP50747 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HLCSP50747 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HLCSP50747 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HLCSP50747 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HLCSP50747 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HLCSP50747 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HLCSP50747 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
HLCSP50747 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HLCSP50747 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HLCSP50747 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HLCSP50747 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25■■□□□ 1.59
HLCSP50747 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HLCSP50747 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HLCSP50747 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HLCSP50747 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HLCSP50747 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HLCSP50747 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HLCSP50747 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HLCSP50747 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HLCSP50747 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HLCSP50747 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HLCSP50747 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HLCSP50747 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HLCSP50747 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HLCSP50747 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HLCSP50747 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HLCSP50747 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HLCSP50747 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HLCSP50747 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HLCSP50747 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HLCSP50747 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HLCSP50747 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HLCSP50747 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HLCSP50747 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
HLCSP50747 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms