Protein–RNA interactions for Protein: P50716

Defa-rs12, Alpha-defensin-related sequence 12, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs12P50716 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Defa-rs12P50716 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Defa-rs12P50716 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Defa-rs12P50716 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Defa-rs12P50716 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Defa-rs12P50716 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Defa-rs12P50716 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Defa-rs12P50716 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Defa-rs12P50716 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Defa-rs12P50716 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Defa-rs12P50716 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Defa-rs12P50716 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Defa-rs12P50716 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Defa-rs12P50716 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Defa-rs12P50716 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Defa-rs12P50716 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Defa-rs12P50716 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Defa-rs12P50716 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Defa-rs12P50716 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Defa-rs12P50716 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Defa-rs12P50716 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Defa-rs12P50716 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Defa-rs12P50716 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Defa-rs12P50716 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Defa-rs12P50716 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Defa-rs12P50716 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Defa-rs12P50716 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Defa-rs12P50716 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Defa-rs12P50716 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Defa-rs12P50716 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Defa-rs12P50716 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Defa-rs12P50716 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Defa-rs12P50716 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Defa-rs12P50716 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Defa-rs12P50716 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Defa-rs12P50716 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Defa-rs12P50716 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Defa-rs12P50716 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Defa-rs12P50716 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Defa-rs12P50716 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Defa-rs12P50716 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Defa-rs12P50716 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Defa-rs12P50716 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Defa-rs12P50716 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Defa-rs12P50716 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Defa-rs12P50716 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Defa-rs12P50716 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Defa-rs12P50716 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Defa-rs12P50716 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Defa-rs12P50716 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Defa-rs12P50716 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Defa-rs12P50716 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Defa-rs12P50716 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Defa-rs12P50716 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Defa-rs12P50716 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Defa-rs12P50716 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Defa-rs12P50716 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Defa-rs12P50716 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Defa-rs12P50716 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Defa-rs12P50716 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Defa-rs12P50716 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Defa-rs12P50716 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Defa-rs12P50716 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Defa-rs12P50716 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Defa-rs12P50716 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Defa-rs12P50716 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Defa-rs12P50716 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Defa-rs12P50716 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Defa-rs12P50716 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Defa-rs12P50716 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Defa-rs12P50716 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Defa-rs12P50716 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Defa-rs12P50716 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Defa-rs12P50716 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Defa-rs12P50716 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Defa-rs12P50716 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Defa-rs12P50716 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Defa-rs12P50716 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Defa-rs12P50716 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Defa-rs12P50716 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Defa-rs12P50716 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Defa-rs12P50716 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Defa-rs12P50716 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Defa-rs12P50716 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Defa-rs12P50716 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Defa-rs12P50716 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Defa-rs12P50716 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Defa-rs12P50716 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Defa-rs12P50716 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Defa-rs12P50716 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Defa-rs12P50716 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Defa-rs12P50716 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Defa-rs12P50716 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Defa-rs12P50716 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Defa-rs12P50716 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Defa-rs12P50716 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Defa-rs12P50716 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Defa-rs12P50716 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Defa-rs12P50716 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Defa-rs12P50716 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms