Protein–RNA interactions for Protein: P50704

Defa6, Alpha-defensin 6/12, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa6P50704 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Defa6P50704 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Defa6P50704 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Defa6P50704 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Defa6P50704 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Defa6P50704 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Defa6P50704 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Defa6P50704 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Defa6P50704 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Defa6P50704 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Defa6P50704 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Defa6P50704 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Defa6P50704 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Defa6P50704 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Defa6P50704 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Defa6P50704 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Defa6P50704 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Defa6P50704 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Defa6P50704 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Defa6P50704 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Defa6P50704 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Defa6P50704 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Defa6P50704 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Defa6P50704 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Defa6P50704 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Defa6P50704 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Defa6P50704 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Defa6P50704 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Defa6P50704 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Defa6P50704 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Defa6P50704 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Defa6P50704 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Defa6P50704 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Defa6P50704 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Defa6P50704 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Defa6P50704 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Defa6P50704 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Defa6P50704 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Defa6P50704 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Defa6P50704 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Defa6P50704 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Defa6P50704 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Defa6P50704 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Defa6P50704 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Defa6P50704 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Defa6P50704 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Defa6P50704 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Defa6P50704 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Defa6P50704 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Defa6P50704 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Defa6P50704 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Defa6P50704 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Defa6P50704 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Defa6P50704 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Defa6P50704 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Defa6P50704 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Defa6P50704 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Defa6P50704 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Defa6P50704 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Defa6P50704 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Defa6P50704 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Defa6P50704 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Defa6P50704 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Defa6P50704 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Defa6P50704 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Defa6P50704 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Defa6P50704 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Defa6P50704 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Defa6P50704 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Defa6P50704 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Defa6P50704 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Defa6P50704 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Defa6P50704 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Defa6P50704 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Defa6P50704 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Defa6P50704 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Defa6P50704 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Defa6P50704 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Defa6P50704 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Defa6P50704 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Defa6P50704 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Defa6P50704 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Defa6P50704 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Defa6P50704 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Defa6P50704 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Defa6P50704 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Defa6P50704 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Defa6P50704 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Defa6P50704 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Defa6P50704 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Defa6P50704 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Defa6P50704 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Defa6P50704 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Defa6P50704 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Defa6P50704 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Defa6P50704 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Defa6P50704 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Defa6P50704 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Defa6P50704 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Defa6P50704 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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