Protein–RNA interactions for Protein: P50549

ETV1, ETS translocation variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV1P50549 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ETV1P50549 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ETV1P50549 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ETV1P50549 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ETV1P50549 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ETV1P50549 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ETV1P50549 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ETV1P50549 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ETV1P50549 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ETV1P50549 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ETV1P50549 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ETV1P50549 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ETV1P50549 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ETV1P50549 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ETV1P50549 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ETV1P50549 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ETV1P50549 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ETV1P50549 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ETV1P50549 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ETV1P50549 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ETV1P50549 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ETV1P50549 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ETV1P50549 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ETV1P50549 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ETV1P50549 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ETV1P50549 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ETV1P50549 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ETV1P50549 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ETV1P50549 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ETV1P50549 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ETV1P50549 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ETV1P50549 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ETV1P50549 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ETV1P50549 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ETV1P50549 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ETV1P50549 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ETV1P50549 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ETV1P50549 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ETV1P50549 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ETV1P50549 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ETV1P50549 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ETV1P50549 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ETV1P50549 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ETV1P50549 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ETV1P50549 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ETV1P50549 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ETV1P50549 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ETV1P50549 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ETV1P50549 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ETV1P50549 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ETV1P50549 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ETV1P50549 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ETV1P50549 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ETV1P50549 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ETV1P50549 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ETV1P50549 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ETV1P50549 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ETV1P50549 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ETV1P50549 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ETV1P50549 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ETV1P50549 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ETV1P50549 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ETV1P50549 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ETV1P50549 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ETV1P50549 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ETV1P50549 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ETV1P50549 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ETV1P50549 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ETV1P50549 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ETV1P50549 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ETV1P50549 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ETV1P50549 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ETV1P50549 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ETV1P50549 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ETV1P50549 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ETV1P50549 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ETV1P50549 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ETV1P50549 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ETV1P50549 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ETV1P50549 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ETV1P50549 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ETV1P50549 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ETV1P50549 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ETV1P50549 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
ETV1P50549 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ETV1P50549 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ETV1P50549 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ETV1P50549 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ETV1P50549 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ETV1P50549 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ETV1P50549 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ETV1P50549 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ETV1P50549 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ETV1P50549 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ETV1P50549 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ETV1P50549 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ETV1P50549 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ETV1P50549 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ETV1P50549 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ETV1P50549 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms