Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERFP50548 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERFP50548 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERFP50548 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERFP50548 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERFP50548 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERFP50548 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ERFP50548 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ERFP50548 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ERFP50548 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ERFP50548 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ERFP50548 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERFP50548 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERFP50548 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERFP50548 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERFP50548 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERFP50548 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERFP50548 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERFP50548 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERFP50548 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ERFP50548 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ERFP50548 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ERFP50548 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ERFP50548 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ERFP50548 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ERFP50548 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERFP50548 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERFP50548 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERFP50548 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERFP50548 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERFP50548 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERFP50548 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERFP50548 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ERFP50548 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERFP50548 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERFP50548 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERFP50548 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERFP50548 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERFP50548 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ERFP50548 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERFP50548 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERFP50548 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERFP50548 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ERFP50548 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ERFP50548 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERFP50548 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERFP50548 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERFP50548 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERFP50548 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERFP50548 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERFP50548 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERFP50548 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERFP50548 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERFP50548 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERFP50548 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERFP50548 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERFP50548 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERFP50548 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERFP50548 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERFP50548 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERFP50548 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERFP50548 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERFP50548 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ERFP50548 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ERFP50548 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ERFP50548 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERFP50548 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERFP50548 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERFP50548 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERFP50548 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERFP50548 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERFP50548 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERFP50548 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ERFP50548 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ERFP50548 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ERFP50548 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ERFP50548 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ERFP50548 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ERFP50548 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ERFP50548 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ERFP50548 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ERFP50548 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ERFP50548 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERFP50548 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERFP50548 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERFP50548 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERFP50548 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERFP50548 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERFP50548 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERFP50548 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERFP50548 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERFP50548 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERFP50548 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERFP50548 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERFP50548 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERFP50548 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERFP50548 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERFP50548 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERFP50548 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERFP50548 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms