Protein–RNA interactions for Protein: P50461

CSRP3, Cysteine and glycine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP3P50461 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CSRP3P50461 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CSRP3P50461 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CSRP3P50461 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CSRP3P50461 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CSRP3P50461 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CSRP3P50461 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CSRP3P50461 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CSRP3P50461 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CSRP3P50461 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CSRP3P50461 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CSRP3P50461 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CSRP3P50461 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CSRP3P50461 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CSRP3P50461 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CSRP3P50461 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CSRP3P50461 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CSRP3P50461 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CSRP3P50461 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CSRP3P50461 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CSRP3P50461 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CSRP3P50461 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CSRP3P50461 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CSRP3P50461 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CSRP3P50461 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CSRP3P50461 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CSRP3P50461 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CSRP3P50461 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CSRP3P50461 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CSRP3P50461 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CSRP3P50461 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CSRP3P50461 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CSRP3P50461 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CSRP3P50461 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CSRP3P50461 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CSRP3P50461 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CSRP3P50461 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CSRP3P50461 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CSRP3P50461 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CSRP3P50461 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
CSRP3P50461 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CSRP3P50461 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CSRP3P50461 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CSRP3P50461 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CSRP3P50461 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CSRP3P50461 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CSRP3P50461 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CSRP3P50461 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CSRP3P50461 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CSRP3P50461 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CSRP3P50461 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CSRP3P50461 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CSRP3P50461 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CSRP3P50461 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CSRP3P50461 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CSRP3P50461 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CSRP3P50461 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CSRP3P50461 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CSRP3P50461 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CSRP3P50461 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CSRP3P50461 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CSRP3P50461 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CSRP3P50461 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CSRP3P50461 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CSRP3P50461 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CSRP3P50461 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CSRP3P50461 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CSRP3P50461 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CSRP3P50461 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CSRP3P50461 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CSRP3P50461 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CSRP3P50461 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CSRP3P50461 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CSRP3P50461 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CSRP3P50461 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CSRP3P50461 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CSRP3P50461 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CSRP3P50461 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
CSRP3P50461 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CSRP3P50461 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CSRP3P50461 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CSRP3P50461 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CSRP3P50461 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CSRP3P50461 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CSRP3P50461 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CSRP3P50461 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CSRP3P50461 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CSRP3P50461 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CSRP3P50461 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CSRP3P50461 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CSRP3P50461 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CSRP3P50461 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CSRP3P50461 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CSRP3P50461 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CSRP3P50461 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CSRP3P50461 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CSRP3P50461 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CSRP3P50461 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CSRP3P50461 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CSRP3P50461 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms