Protein–RNA interactions for Protein: P50213

IDH3A, Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IDH3AP50213 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
IDH3AP50213 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
IDH3AP50213 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
IDH3AP50213 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
IDH3AP50213 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
IDH3AP50213 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
IDH3AP50213 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
IDH3AP50213 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
IDH3AP50213 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
IDH3AP50213 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
IDH3AP50213 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
IDH3AP50213 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
IDH3AP50213 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
IDH3AP50213 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
IDH3AP50213 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
IDH3AP50213 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
IDH3AP50213 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
IDH3AP50213 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
IDH3AP50213 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
IDH3AP50213 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
IDH3AP50213 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
IDH3AP50213 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
IDH3AP50213 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
IDH3AP50213 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
IDH3AP50213 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
IDH3AP50213 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
IDH3AP50213 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
IDH3AP50213 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
IDH3AP50213 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
IDH3AP50213 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
IDH3AP50213 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
IDH3AP50213 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
IDH3AP50213 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
IDH3AP50213 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
IDH3AP50213 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
IDH3AP50213 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
IDH3AP50213 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
IDH3AP50213 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
IDH3AP50213 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
IDH3AP50213 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
IDH3AP50213 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
IDH3AP50213 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
IDH3AP50213 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
IDH3AP50213 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
IDH3AP50213 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
IDH3AP50213 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
IDH3AP50213 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
IDH3AP50213 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
IDH3AP50213 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
IDH3AP50213 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
IDH3AP50213 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
IDH3AP50213 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
IDH3AP50213 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
IDH3AP50213 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
IDH3AP50213 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
IDH3AP50213 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
IDH3AP50213 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
IDH3AP50213 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
IDH3AP50213 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
IDH3AP50213 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
IDH3AP50213 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
IDH3AP50213 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
IDH3AP50213 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
IDH3AP50213 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
IDH3AP50213 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
IDH3AP50213 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
IDH3AP50213 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
IDH3AP50213 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
IDH3AP50213 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
IDH3AP50213 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
IDH3AP50213 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
IDH3AP50213 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
IDH3AP50213 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
IDH3AP50213 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
IDH3AP50213 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IDH3AP50213 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
IDH3AP50213 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
IDH3AP50213 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
IDH3AP50213 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
IDH3AP50213 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
IDH3AP50213 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
IDH3AP50213 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IDH3AP50213 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
IDH3AP50213 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
IDH3AP50213 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
IDH3AP50213 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
IDH3AP50213 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
IDH3AP50213 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
IDH3AP50213 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
IDH3AP50213 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
IDH3AP50213 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
IDH3AP50213 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
IDH3AP50213 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
IDH3AP50213 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
IDH3AP50213 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IDH3AP50213 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IDH3AP50213 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
IDH3AP50213 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IDH3AP50213 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IDH3AP50213 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms