Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CASP4P49662 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CASP4P49662 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CASP4P49662 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
CASP4P49662 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CASP4P49662 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CASP4P49662 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CASP4P49662 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CASP4P49662 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CASP4P49662 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CASP4P49662 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CASP4P49662 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CASP4P49662 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CASP4P49662 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CASP4P49662 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CASP4P49662 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CASP4P49662 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CASP4P49662 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CASP4P49662 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CASP4P49662 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CASP4P49662 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CASP4P49662 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CASP4P49662 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CASP4P49662 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CASP4P49662 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CASP4P49662 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CASP4P49662 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CASP4P49662 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
CASP4P49662 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CASP4P49662 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CASP4P49662 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CASP4P49662 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CASP4P49662 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CASP4P49662 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CASP4P49662 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CASP4P49662 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CASP4P49662 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CASP4P49662 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CASP4P49662 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CASP4P49662 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CASP4P49662 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CASP4P49662 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CASP4P49662 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CASP4P49662 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CASP4P49662 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CASP4P49662 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CASP4P49662 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CASP4P49662 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CASP4P49662 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CASP4P49662 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CASP4P49662 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CASP4P49662 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CASP4P49662 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CASP4P49662 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CASP4P49662 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CASP4P49662 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CASP4P49662 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CASP4P49662 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CASP4P49662 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CASP4P49662 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CASP4P49662 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CASP4P49662 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CASP4P49662 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CASP4P49662 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CASP4P49662 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CASP4P49662 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CASP4P49662 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CASP4P49662 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CASP4P49662 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CASP4P49662 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CASP4P49662 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CASP4P49662 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CASP4P49662 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CASP4P49662 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CASP4P49662 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CASP4P49662 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CASP4P49662 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
CASP4P49662 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CASP4P49662 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CASP4P49662 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CASP4P49662 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CASP4P49662 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CASP4P49662 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CASP4P49662 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CASP4P49662 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CASP4P49662 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CASP4P49662 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CASP4P49662 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CASP4P49662 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CASP4P49662 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CASP4P49662 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CASP4P49662 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CASP4P49662 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CASP4P49662 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CASP4P49662 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CASP4P49662 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
CASP4P49662 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CASP4P49662 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CASP4P49662 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CASP4P49662 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms