Protein–RNA interactions for Protein: P49450

CENPA, Histone H3-like centromeric protein A, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPAP49450 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CENPAP49450 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CENPAP49450 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CENPAP49450 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CENPAP49450 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CENPAP49450 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CENPAP49450 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CENPAP49450 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CENPAP49450 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CENPAP49450 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CENPAP49450 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CENPAP49450 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CENPAP49450 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CENPAP49450 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CENPAP49450 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CENPAP49450 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CENPAP49450 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CENPAP49450 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CENPAP49450 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CENPAP49450 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CENPAP49450 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CENPAP49450 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CENPAP49450 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CENPAP49450 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CENPAP49450 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CENPAP49450 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CENPAP49450 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CENPAP49450 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CENPAP49450 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CENPAP49450 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CENPAP49450 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CENPAP49450 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CENPAP49450 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CENPAP49450 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CENPAP49450 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CENPAP49450 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CENPAP49450 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CENPAP49450 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CENPAP49450 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CENPAP49450 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CENPAP49450 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CENPAP49450 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CENPAP49450 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CENPAP49450 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CENPAP49450 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CENPAP49450 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CENPAP49450 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CENPAP49450 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CENPAP49450 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CENPAP49450 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CENPAP49450 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CENPAP49450 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CENPAP49450 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
CENPAP49450 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CENPAP49450 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CENPAP49450 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CENPAP49450 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CENPAP49450 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CENPAP49450 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CENPAP49450 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CENPAP49450 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CENPAP49450 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CENPAP49450 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CENPAP49450 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CENPAP49450 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CENPAP49450 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CENPAP49450 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CENPAP49450 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CENPAP49450 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CENPAP49450 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CENPAP49450 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CENPAP49450 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CENPAP49450 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CENPAP49450 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CENPAP49450 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CENPAP49450 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CENPAP49450 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPAP49450 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPAP49450 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CENPAP49450 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CENPAP49450 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CENPAP49450 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPAP49450 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPAP49450 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPAP49450 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CENPAP49450 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CENPAP49450 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CENPAP49450 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CENPAP49450 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CENPAP49450 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CENPAP49450 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CENPAP49450 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CENPAP49450 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CENPAP49450 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CENPAP49450 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CENPAP49450 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CENPAP49450 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CENPAP49450 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CENPAP49450 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CENPAP49450 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms