Protein–RNA interactions for Protein: P49135

Ercc3, General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc3P49135 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ercc3P49135 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ercc3P49135 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ercc3P49135 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ercc3P49135 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ercc3P49135 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ercc3P49135 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ercc3P49135 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ercc3P49135 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ercc3P49135 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ercc3P49135 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ercc3P49135 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Ercc3P49135 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Ercc3P49135 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Ercc3P49135 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Ercc3P49135 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ercc3P49135 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ercc3P49135 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ercc3P49135 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ercc3P49135 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ercc3P49135 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ercc3P49135 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ercc3P49135 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Ercc3P49135 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ercc3P49135 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ercc3P49135 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
Ercc3P49135 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ercc3P49135 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ercc3P49135 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ercc3P49135 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ercc3P49135 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ercc3P49135 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ercc3P49135 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ercc3P49135 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Ercc3P49135 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ercc3P49135 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ercc3P49135 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ercc3P49135 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ercc3P49135 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ercc3P49135 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Ercc3P49135 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ercc3P49135 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ercc3P49135 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ercc3P49135 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ercc3P49135 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ercc3P49135 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ercc3P49135 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ercc3P49135 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ercc3P49135 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ercc3P49135 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Ercc3P49135 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.28
Ercc3P49135 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Ercc3P49135 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ercc3P49135 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ercc3P49135 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ercc3P49135 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ercc3P49135 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ercc3P49135 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ercc3P49135 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ercc3P49135 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ercc3P49135 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ercc3P49135 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ercc3P49135 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ercc3P49135 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ercc3P49135 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ercc3P49135 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ercc3P49135 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Ercc3P49135 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ercc3P49135 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ercc3P49135 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ercc3P49135 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ercc3P49135 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ercc3P49135 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ercc3P49135 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ercc3P49135 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ercc3P49135 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ercc3P49135 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ercc3P49135 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ercc3P49135 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ercc3P49135 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ercc3P49135 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ercc3P49135 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ercc3P49135 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ercc3P49135 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ercc3P49135 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ercc3P49135 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ercc3P49135 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Ercc3P49135 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ercc3P49135 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ercc3P49135 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ercc3P49135 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ercc3P49135 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ercc3P49135 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ercc3P49135 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ercc3P49135 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ercc3P49135 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ercc3P49135 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ercc3P49135 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Ercc3P49135 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ercc3P49135 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms