Protein–RNA interactions for Protein: P48553

TRAPPC10, Trafficking protein particle complex subunit 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10P48553 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
TRAPPC10P48553 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
TRAPPC10P48553 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
TRAPPC10P48553 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
TRAPPC10P48553 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
TRAPPC10P48553 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
TRAPPC10P48553 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
TRAPPC10P48553 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
TRAPPC10P48553 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
TRAPPC10P48553 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
TRAPPC10P48553 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
TRAPPC10P48553 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
TRAPPC10P48553 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
TRAPPC10P48553 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
TRAPPC10P48553 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
TRAPPC10P48553 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
TRAPPC10P48553 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
TRAPPC10P48553 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
TRAPPC10P48553 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
TRAPPC10P48553 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
TRAPPC10P48553 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
TRAPPC10P48553 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
TRAPPC10P48553 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
TRAPPC10P48553 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
TRAPPC10P48553 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
TRAPPC10P48553 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
TRAPPC10P48553 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
TRAPPC10P48553 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
TRAPPC10P48553 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
TRAPPC10P48553 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
TRAPPC10P48553 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
TRAPPC10P48553 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
TRAPPC10P48553 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
TRAPPC10P48553 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
TRAPPC10P48553 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
TRAPPC10P48553 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
TRAPPC10P48553 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
TRAPPC10P48553 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TRAPPC10P48553 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
TRAPPC10P48553 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
TRAPPC10P48553 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TRAPPC10P48553 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TRAPPC10P48553 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
TRAPPC10P48553 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
TRAPPC10P48553 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
TRAPPC10P48553 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TRAPPC10P48553 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TRAPPC10P48553 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TRAPPC10P48553 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TRAPPC10P48553 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TRAPPC10P48553 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TRAPPC10P48553 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TRAPPC10P48553 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
TRAPPC10P48553 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TRAPPC10P48553 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
TRAPPC10P48553 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
TRAPPC10P48553 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TRAPPC10P48553 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TRAPPC10P48553 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TRAPPC10P48553 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TRAPPC10P48553 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
TRAPPC10P48553 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
TRAPPC10P48553 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
TRAPPC10P48553 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
TRAPPC10P48553 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TRAPPC10P48553 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TRAPPC10P48553 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TRAPPC10P48553 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
TRAPPC10P48553 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TRAPPC10P48553 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TRAPPC10P48553 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
TRAPPC10P48553 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TRAPPC10P48553 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TRAPPC10P48553 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
TRAPPC10P48553 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
TRAPPC10P48553 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
TRAPPC10P48553 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TRAPPC10P48553 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.41
TRAPPC10P48553 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TRAPPC10P48553 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TRAPPC10P48553 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TRAPPC10P48553 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TRAPPC10P48553 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TRAPPC10P48553 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TRAPPC10P48553 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
TRAPPC10P48553 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TRAPPC10P48553 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TRAPPC10P48553 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TRAPPC10P48553 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TRAPPC10P48553 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TRAPPC10P48553 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TRAPPC10P48553 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TRAPPC10P48553 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
TRAPPC10P48553 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
TRAPPC10P48553 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
TRAPPC10P48553 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TRAPPC10P48553 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.39
TRAPPC10P48553 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TRAPPC10P48553 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TRAPPC10P48553 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms