Protein–RNA interactions for Protein: P48052

CPA2, Carboxypeptidase A2, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA2P48052 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CPA2P48052 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CPA2P48052 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CPA2P48052 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CPA2P48052 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CPA2P48052 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CPA2P48052 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CPA2P48052 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CPA2P48052 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CPA2P48052 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CPA2P48052 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CPA2P48052 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CPA2P48052 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CPA2P48052 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CPA2P48052 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CPA2P48052 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CPA2P48052 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CPA2P48052 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CPA2P48052 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CPA2P48052 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CPA2P48052 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CPA2P48052 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CPA2P48052 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CPA2P48052 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CPA2P48052 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CPA2P48052 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CPA2P48052 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CPA2P48052 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CPA2P48052 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CPA2P48052 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CPA2P48052 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CPA2P48052 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CPA2P48052 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CPA2P48052 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CPA2P48052 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CPA2P48052 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CPA2P48052 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CPA2P48052 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CPA2P48052 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CPA2P48052 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CPA2P48052 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CPA2P48052 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CPA2P48052 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CPA2P48052 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CPA2P48052 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CPA2P48052 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CPA2P48052 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CPA2P48052 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CPA2P48052 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CPA2P48052 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CPA2P48052 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CPA2P48052 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CPA2P48052 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CPA2P48052 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CPA2P48052 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CPA2P48052 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CPA2P48052 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CPA2P48052 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CPA2P48052 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CPA2P48052 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CPA2P48052 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CPA2P48052 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CPA2P48052 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CPA2P48052 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CPA2P48052 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CPA2P48052 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CPA2P48052 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CPA2P48052 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CPA2P48052 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CPA2P48052 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CPA2P48052 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CPA2P48052 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CPA2P48052 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CPA2P48052 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CPA2P48052 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CPA2P48052 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CPA2P48052 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CPA2P48052 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CPA2P48052 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CPA2P48052 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CPA2P48052 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CPA2P48052 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CPA2P48052 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CPA2P48052 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CPA2P48052 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CPA2P48052 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CPA2P48052 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CPA2P48052 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CPA2P48052 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CPA2P48052 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CPA2P48052 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CPA2P48052 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CPA2P48052 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CPA2P48052 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CPA2P48052 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CPA2P48052 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CPA2P48052 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CPA2P48052 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CPA2P48052 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CPA2P48052 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms