Protein–RNA interactions for Protein: P47895

ALDH1A3, Aldehyde dehydrogenase family 1 member A3, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH1A3P47895 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ALDH1A3P47895 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ALDH1A3P47895 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ALDH1A3P47895 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ALDH1A3P47895 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ALDH1A3P47895 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ALDH1A3P47895 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ALDH1A3P47895 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ALDH1A3P47895 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ALDH1A3P47895 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ALDH1A3P47895 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ALDH1A3P47895 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ALDH1A3P47895 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ALDH1A3P47895 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ALDH1A3P47895 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ALDH1A3P47895 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ALDH1A3P47895 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ALDH1A3P47895 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ALDH1A3P47895 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
ALDH1A3P47895 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
ALDH1A3P47895 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ALDH1A3P47895 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ALDH1A3P47895 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ALDH1A3P47895 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
ALDH1A3P47895 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ALDH1A3P47895 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
ALDH1A3P47895 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ALDH1A3P47895 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ALDH1A3P47895 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ALDH1A3P47895 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ALDH1A3P47895 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ALDH1A3P47895 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ALDH1A3P47895 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ALDH1A3P47895 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ALDH1A3P47895 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ALDH1A3P47895 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ALDH1A3P47895 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ALDH1A3P47895 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ALDH1A3P47895 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ALDH1A3P47895 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ALDH1A3P47895 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ALDH1A3P47895 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ALDH1A3P47895 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ALDH1A3P47895 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ALDH1A3P47895 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ALDH1A3P47895 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
ALDH1A3P47895 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ALDH1A3P47895 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
ALDH1A3P47895 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ALDH1A3P47895 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ALDH1A3P47895 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ALDH1A3P47895 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ALDH1A3P47895 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ALDH1A3P47895 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ALDH1A3P47895 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ALDH1A3P47895 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ALDH1A3P47895 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
ALDH1A3P47895 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ALDH1A3P47895 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ALDH1A3P47895 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ALDH1A3P47895 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ALDH1A3P47895 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ALDH1A3P47895 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ALDH1A3P47895 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ALDH1A3P47895 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ALDH1A3P47895 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ALDH1A3P47895 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ALDH1A3P47895 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ALDH1A3P47895 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ALDH1A3P47895 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ALDH1A3P47895 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ALDH1A3P47895 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ALDH1A3P47895 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ALDH1A3P47895 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
ALDH1A3P47895 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ALDH1A3P47895 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ALDH1A3P47895 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ALDH1A3P47895 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ALDH1A3P47895 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ALDH1A3P47895 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ALDH1A3P47895 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ALDH1A3P47895 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ALDH1A3P47895 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ALDH1A3P47895 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ALDH1A3P47895 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ALDH1A3P47895 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ALDH1A3P47895 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ALDH1A3P47895 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ALDH1A3P47895 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ALDH1A3P47895 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ALDH1A3P47895 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ALDH1A3P47895 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ALDH1A3P47895 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
ALDH1A3P47895 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ALDH1A3P47895 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ALDH1A3P47895 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ALDH1A3P47895 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ALDH1A3P47895 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ALDH1A3P47895 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ALDH1A3P47895 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms