Protein–RNA interactions for Protein: P47756

CAPZB, F-actin-capping protein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZBP47756 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CAPZBP47756 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CAPZBP47756 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CAPZBP47756 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CAPZBP47756 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CAPZBP47756 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CAPZBP47756 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAPZBP47756 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAPZBP47756 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAPZBP47756 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CAPZBP47756 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CAPZBP47756 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CAPZBP47756 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CAPZBP47756 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CAPZBP47756 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAPZBP47756 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CAPZBP47756 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CAPZBP47756 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CAPZBP47756 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CAPZBP47756 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAPZBP47756 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAPZBP47756 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAPZBP47756 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CAPZBP47756 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CAPZBP47756 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CAPZBP47756 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CAPZBP47756 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CAPZBP47756 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CAPZBP47756 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CAPZBP47756 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CAPZBP47756 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CAPZBP47756 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CAPZBP47756 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CAPZBP47756 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CAPZBP47756 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CAPZBP47756 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CAPZBP47756 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CAPZBP47756 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CAPZBP47756 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CAPZBP47756 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CAPZBP47756 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CAPZBP47756 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CAPZBP47756 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CAPZBP47756 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CAPZBP47756 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CAPZBP47756 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CAPZBP47756 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAPZBP47756 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAPZBP47756 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAPZBP47756 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CAPZBP47756 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAPZBP47756 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CAPZBP47756 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CAPZBP47756 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CAPZBP47756 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CAPZBP47756 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CAPZBP47756 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CAPZBP47756 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CAPZBP47756 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CAPZBP47756 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CAPZBP47756 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CAPZBP47756 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CAPZBP47756 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CAPZBP47756 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CAPZBP47756 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CAPZBP47756 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CAPZBP47756 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CAPZBP47756 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CAPZBP47756 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CAPZBP47756 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CAPZBP47756 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CAPZBP47756 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CAPZBP47756 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CAPZBP47756 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CAPZBP47756 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CAPZBP47756 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CAPZBP47756 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CAPZBP47756 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CAPZBP47756 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CAPZBP47756 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CAPZBP47756 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CAPZBP47756 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CAPZBP47756 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CAPZBP47756 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAPZBP47756 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAPZBP47756 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAPZBP47756 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAPZBP47756 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAPZBP47756 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAPZBP47756 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAPZBP47756 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CAPZBP47756 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CAPZBP47756 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CAPZBP47756 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CAPZBP47756 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CAPZBP47756 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CAPZBP47756 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAPZBP47756 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAPZBP47756 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAPZBP47756 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms