Protein–RNA interactions for Protein: P46940

IQGAP1, Ras GTPase-activating-like protein IQGAP1, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IQGAP1P46940 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
IQGAP1P46940 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.18■■■■□ 3.86
IQGAP1P46940 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC39.18■■■■□ 3.86
IQGAP1P46940 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC39.17■■■■□ 3.86
IQGAP1P46940 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.16■■■■□ 3.86
IQGAP1P46940 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC39.15■■■■□ 3.86
IQGAP1P46940 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
IQGAP1P46940 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC39.14■■■■□ 3.86
IQGAP1P46940 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC39.14■■■■□ 3.86
IQGAP1P46940 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC39.14■■■■□ 3.86
IQGAP1P46940 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC39.14■■■■□ 3.86
IQGAP1P46940 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
IQGAP1P46940 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
IQGAP1P46940 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.13■■■■□ 3.86
IQGAP1P46940 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC39.12■■■■□ 3.85
IQGAP1P46940 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
IQGAP1P46940 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
IQGAP1P46940 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
IQGAP1P46940 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
IQGAP1P46940 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC39.06■■■■□ 3.84
IQGAP1P46940 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC39.06■■■■□ 3.84
IQGAP1P46940 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
IQGAP1P46940 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.04■■■■□ 3.84
IQGAP1P46940 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
IQGAP1P46940 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC39.04■■■■□ 3.84
IQGAP1P46940 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
IQGAP1P46940 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC39.03■■■■□ 3.84
IQGAP1P46940 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
IQGAP1P46940 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
IQGAP1P46940 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
IQGAP1P46940 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
IQGAP1P46940 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
IQGAP1P46940 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC39.01■■■■□ 3.84
IQGAP1P46940 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC39.01■■■■□ 3.84
IQGAP1P46940 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
IQGAP1P46940 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
IQGAP1P46940 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
IQGAP1P46940 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
IQGAP1P46940 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
IQGAP1P46940 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC38.98■■■■□ 3.83
IQGAP1P46940 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC38.98■■■■□ 3.83
IQGAP1P46940 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
IQGAP1P46940 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC38.97■■■■□ 3.83
IQGAP1P46940 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
IQGAP1P46940 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
IQGAP1P46940 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
IQGAP1P46940 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
IQGAP1P46940 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
IQGAP1P46940 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
IQGAP1P46940 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
IQGAP1P46940 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC38.92■■■■□ 3.82
IQGAP1P46940 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
IQGAP1P46940 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
IQGAP1P46940 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC38.87■■■■□ 3.81
IQGAP1P46940 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.87■■■■□ 3.81
IQGAP1P46940 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC38.86■■■■□ 3.81
IQGAP1P46940 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
IQGAP1P46940 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
IQGAP1P46940 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
IQGAP1P46940 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
IQGAP1P46940 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.84■■■■□ 3.81
IQGAP1P46940 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC38.84■■■■□ 3.81
IQGAP1P46940 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC38.84■■■■□ 3.81
IQGAP1P46940 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.8■■■■□ 3.8
IQGAP1P46940 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
IQGAP1P46940 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC38.8■■■■□ 3.8
IQGAP1P46940 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
IQGAP1P46940 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
IQGAP1P46940 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC38.79■■■■□ 3.8
IQGAP1P46940 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
IQGAP1P46940 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
IQGAP1P46940 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC38.76■■■■□ 3.8
IQGAP1P46940 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC38.76■■■■□ 3.79
IQGAP1P46940 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC38.75■■■■□ 3.79
IQGAP1P46940 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC38.74■■■■□ 3.79
IQGAP1P46940 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
IQGAP1P46940 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC38.74■■■■□ 3.79
IQGAP1P46940 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
IQGAP1P46940 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
IQGAP1P46940 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC38.73■■■■□ 3.79
IQGAP1P46940 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
IQGAP1P46940 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC38.71■■■■□ 3.79
IQGAP1P46940 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
IQGAP1P46940 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
IQGAP1P46940 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
IQGAP1P46940 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
IQGAP1P46940 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
IQGAP1P46940 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC38.67■■■■□ 3.78
IQGAP1P46940 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
IQGAP1P46940 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC38.67■■■■□ 3.78
IQGAP1P46940 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.67■■■■□ 3.78
IQGAP1P46940 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
IQGAP1P46940 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC38.65■■■■□ 3.78
IQGAP1P46940 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC38.65■■■■□ 3.78
IQGAP1P46940 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC38.65■■■■□ 3.78
IQGAP1P46940 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC38.64■■■■□ 3.78
IQGAP1P46940 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC38.64■■■■□ 3.78
IQGAP1P46940 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.63■■■■□ 3.77
IQGAP1P46940 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
IQGAP1P46940 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 164.6 ms