Protein–RNA interactions for Protein: P43358

MAGEA4, Melanoma-associated antigen 4, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEA4P43358 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MAGEA4P43358 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MAGEA4P43358 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MAGEA4P43358 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MAGEA4P43358 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MAGEA4P43358 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MAGEA4P43358 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MAGEA4P43358 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MAGEA4P43358 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MAGEA4P43358 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MAGEA4P43358 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MAGEA4P43358 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MAGEA4P43358 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MAGEA4P43358 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MAGEA4P43358 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MAGEA4P43358 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MAGEA4P43358 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MAGEA4P43358 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
MAGEA4P43358 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MAGEA4P43358 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MAGEA4P43358 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MAGEA4P43358 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MAGEA4P43358 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MAGEA4P43358 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MAGEA4P43358 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MAGEA4P43358 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MAGEA4P43358 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MAGEA4P43358 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MAGEA4P43358 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MAGEA4P43358 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MAGEA4P43358 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MAGEA4P43358 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MAGEA4P43358 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MAGEA4P43358 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MAGEA4P43358 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MAGEA4P43358 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MAGEA4P43358 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
MAGEA4P43358 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MAGEA4P43358 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MAGEA4P43358 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MAGEA4P43358 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MAGEA4P43358 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MAGEA4P43358 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MAGEA4P43358 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MAGEA4P43358 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MAGEA4P43358 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MAGEA4P43358 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MAGEA4P43358 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MAGEA4P43358 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MAGEA4P43358 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MAGEA4P43358 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MAGEA4P43358 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MAGEA4P43358 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MAGEA4P43358 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MAGEA4P43358 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MAGEA4P43358 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
MAGEA4P43358 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MAGEA4P43358 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MAGEA4P43358 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MAGEA4P43358 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MAGEA4P43358 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MAGEA4P43358 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MAGEA4P43358 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MAGEA4P43358 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MAGEA4P43358 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MAGEA4P43358 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MAGEA4P43358 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MAGEA4P43358 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MAGEA4P43358 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MAGEA4P43358 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MAGEA4P43358 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MAGEA4P43358 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MAGEA4P43358 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MAGEA4P43358 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MAGEA4P43358 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MAGEA4P43358 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MAGEA4P43358 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MAGEA4P43358 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MAGEA4P43358 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MAGEA4P43358 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MAGEA4P43358 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
MAGEA4P43358 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
MAGEA4P43358 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MAGEA4P43358 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MAGEA4P43358 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MAGEA4P43358 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MAGEA4P43358 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MAGEA4P43358 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MAGEA4P43358 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MAGEA4P43358 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MAGEA4P43358 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MAGEA4P43358 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MAGEA4P43358 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MAGEA4P43358 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MAGEA4P43358 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MAGEA4P43358 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MAGEA4P43358 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MAGEA4P43358 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MAGEA4P43358 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MAGEA4P43358 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms