Protein–RNA interactions for Protein: P42126

ECI1, Enoyl-CoA delta isomerase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECI1P42126 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ECI1P42126 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ECI1P42126 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ECI1P42126 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ECI1P42126 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ECI1P42126 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ECI1P42126 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ECI1P42126 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ECI1P42126 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ECI1P42126 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ECI1P42126 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ECI1P42126 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ECI1P42126 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
ECI1P42126 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ECI1P42126 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ECI1P42126 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ECI1P42126 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ECI1P42126 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ECI1P42126 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ECI1P42126 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ECI1P42126 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ECI1P42126 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ECI1P42126 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ECI1P42126 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ECI1P42126 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ECI1P42126 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ECI1P42126 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ECI1P42126 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ECI1P42126 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ECI1P42126 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ECI1P42126 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ECI1P42126 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ECI1P42126 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ECI1P42126 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ECI1P42126 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ECI1P42126 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ECI1P42126 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ECI1P42126 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ECI1P42126 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ECI1P42126 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ECI1P42126 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ECI1P42126 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ECI1P42126 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ECI1P42126 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ECI1P42126 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ECI1P42126 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ECI1P42126 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ECI1P42126 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ECI1P42126 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ECI1P42126 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ECI1P42126 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ECI1P42126 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ECI1P42126 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ECI1P42126 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ECI1P42126 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ECI1P42126 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ECI1P42126 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ECI1P42126 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ECI1P42126 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ECI1P42126 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ECI1P42126 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ECI1P42126 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ECI1P42126 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ECI1P42126 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ECI1P42126 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ECI1P42126 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ECI1P42126 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ECI1P42126 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ECI1P42126 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ECI1P42126 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ECI1P42126 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ECI1P42126 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ECI1P42126 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ECI1P42126 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ECI1P42126 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ECI1P42126 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ECI1P42126 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ECI1P42126 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ECI1P42126 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ECI1P42126 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ECI1P42126 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ECI1P42126 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ECI1P42126 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ECI1P42126 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ECI1P42126 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ECI1P42126 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ECI1P42126 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ECI1P42126 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ECI1P42126 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ECI1P42126 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ECI1P42126 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ECI1P42126 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ECI1P42126 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ECI1P42126 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ECI1P42126 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ECI1P42126 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ECI1P42126 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ECI1P42126 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ECI1P42126 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ECI1P42126 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms