Protein–RNA interactions for Protein: P41240

CSK, Tyrosine-protein kinase CSK, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSKP41240 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CSKP41240 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CSKP41240 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CSKP41240 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CSKP41240 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CSKP41240 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CSKP41240 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CSKP41240 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CSKP41240 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CSKP41240 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CSKP41240 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CSKP41240 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CSKP41240 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CSKP41240 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CSKP41240 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CSKP41240 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CSKP41240 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CSKP41240 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CSKP41240 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CSKP41240 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CSKP41240 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CSKP41240 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CSKP41240 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CSKP41240 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CSKP41240 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CSKP41240 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CSKP41240 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CSKP41240 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CSKP41240 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CSKP41240 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CSKP41240 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CSKP41240 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CSKP41240 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CSKP41240 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CSKP41240 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CSKP41240 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CSKP41240 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CSKP41240 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CSKP41240 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CSKP41240 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CSKP41240 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CSKP41240 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CSKP41240 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CSKP41240 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CSKP41240 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CSKP41240 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CSKP41240 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CSKP41240 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CSKP41240 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CSKP41240 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CSKP41240 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CSKP41240 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CSKP41240 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CSKP41240 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CSKP41240 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CSKP41240 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CSKP41240 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CSKP41240 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CSKP41240 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CSKP41240 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CSKP41240 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CSKP41240 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CSKP41240 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CSKP41240 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CSKP41240 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CSKP41240 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CSKP41240 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CSKP41240 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CSKP41240 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CSKP41240 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CSKP41240 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CSKP41240 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CSKP41240 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CSKP41240 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CSKP41240 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CSKP41240 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CSKP41240 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CSKP41240 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CSKP41240 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CSKP41240 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CSKP41240 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CSKP41240 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CSKP41240 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CSKP41240 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CSKP41240 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CSKP41240 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CSKP41240 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CSKP41240 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CSKP41240 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CSKP41240 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CSKP41240 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CSKP41240 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CSKP41240 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CSKP41240 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CSKP41240 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CSKP41240 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CSKP41240 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CSKP41240 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CSKP41240 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CSKP41240 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.6 ms