Protein–RNA interactions for Protein: P40926

MDH2, Malate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH2P40926 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MDH2P40926 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MDH2P40926 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MDH2P40926 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MDH2P40926 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MDH2P40926 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MDH2P40926 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MDH2P40926 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MDH2P40926 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MDH2P40926 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MDH2P40926 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MDH2P40926 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MDH2P40926 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MDH2P40926 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MDH2P40926 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MDH2P40926 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MDH2P40926 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MDH2P40926 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MDH2P40926 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MDH2P40926 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MDH2P40926 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MDH2P40926 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MDH2P40926 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MDH2P40926 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MDH2P40926 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MDH2P40926 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MDH2P40926 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MDH2P40926 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MDH2P40926 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MDH2P40926 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MDH2P40926 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MDH2P40926 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MDH2P40926 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MDH2P40926 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MDH2P40926 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MDH2P40926 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MDH2P40926 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MDH2P40926 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MDH2P40926 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
MDH2P40926 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MDH2P40926 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MDH2P40926 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MDH2P40926 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MDH2P40926 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MDH2P40926 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MDH2P40926 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MDH2P40926 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MDH2P40926 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MDH2P40926 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MDH2P40926 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MDH2P40926 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MDH2P40926 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MDH2P40926 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MDH2P40926 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MDH2P40926 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MDH2P40926 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MDH2P40926 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MDH2P40926 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MDH2P40926 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MDH2P40926 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MDH2P40926 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MDH2P40926 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MDH2P40926 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MDH2P40926 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MDH2P40926 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MDH2P40926 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MDH2P40926 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MDH2P40926 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MDH2P40926 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MDH2P40926 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MDH2P40926 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MDH2P40926 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MDH2P40926 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MDH2P40926 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MDH2P40926 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MDH2P40926 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MDH2P40926 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MDH2P40926 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MDH2P40926 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MDH2P40926 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MDH2P40926 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MDH2P40926 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MDH2P40926 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MDH2P40926 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MDH2P40926 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MDH2P40926 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MDH2P40926 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MDH2P40926 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MDH2P40926 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MDH2P40926 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MDH2P40926 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MDH2P40926 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MDH2P40926 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MDH2P40926 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MDH2P40926 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MDH2P40926 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MDH2P40926 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MDH2P40926 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MDH2P40926 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MDH2P40926 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.9 ms