Protein–RNA interactions for Protein: P40048

PTP3, Tyrosine-protein phosphatase 3, yeastyeast

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Length 928 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PTP3P40048 NAS6YGR232W 687 nt13.28□□□□□ -0.28
PTP3P40048 PEX2YJL210W 816 nt13.28□□□□□ -0.28
PTP3P40048 YLR311CYLR311C 348 nt13.28□□□□□ -0.28
PTP3P40048 YBL081WYBL081W 1107 nt13.28□□□□□ -0.28
PTP3P40048 BNA3YJL060W 1335 nt13.26□□□□□ -0.29
PTP3P40048 VPS28YPL065W 729 nt13.26□□□□□ -0.29
PTP3P40048 YPI1YFR003C 468 nt13.25□□□□□ -0.29
PTP3P40048 tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 73 nt13.25□□□□□ -0.29
PTP3P40048 SEC11YIR022W 504 nt13.25□□□□□ -0.29
PTP3P40048 RAX1YOR301W 1308 nt13.24□□□□□ -0.29
PTP3P40048 AIM41YOR215C 558 nt13.24□□□□□ -0.29
PTP3P40048 SCO2YBR024W 906 nt13.24□□□□□ -0.29
PTP3P40048 NRT1YOR071C 1797 nt13.23□□□□□ -0.29
PTP3P40048 YMR119W-AYMR119W-A 375 nt13.22□□□□□ -0.29
PTP3P40048 DUT1YBR252W 444 nt13.22□□□□□ -0.29
PTP3P40048 YNL234WYNL234W 1281 nt13.21□□□□□ -0.29
PTP3P40048 YJL211CYJL211C 444 nt13.2□□□□□ -0.3
PTP3P40048 AAC1YMR056C 930 nt13.2□□□□□ -0.3
PTP3P40048 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt13.2□□□□□ -0.3
PTP3P40048 HIP1YGR191W 1812 nt13.2□□□□□ -0.3
PTP3P40048 YPR1YDR368W 939 nt13.19□□□□□ -0.3
PTP3P40048 DIA1YMR316W 1011 nt13.19□□□□□ -0.3
PTP3P40048 MSB4YOL112W 1479 nt13.18□□□□□ -0.3
PTP3P40048 YDL157CYDL157C 357 nt13.18□□□□□ -0.3
PTP3P40048 RSC4YKR008W 1878 nt13.17□□□□□ -0.3
PTP3P40048 YJR114WYJR114W 393 nt13.17□□□□□ -0.3
PTP3P40048 TSR2YLR435W 618 nt13.17□□□□□ -0.3
PTP3P40048 SWP1YMR149W 861 nt13.17□□□□□ -0.3
PTP3P40048 EEB1YPL095C 1371 nt13.16□□□□□ -0.3
PTP3P40048 YNL040WYNL040W 1371 nt13.15□□□□□ -0.3
PTP3P40048 LOT5YKL183W 921 nt13.14□□□□□ -0.31
PTP3P40048 TIR3YIL011W 810 nt13.13□□□□□ -0.31
PTP3P40048 SUA5YGL169W 1281 nt13.12□□□□□ -0.31
PTP3P40048 TAZ1YPR140W 1146 nt13.11□□□□□ -0.31
PTP3P40048 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt13.1□□□□□ -0.31
PTP3P40048 YHR054CYHR054C 1065 nt13.1□□□□□ -0.31
PTP3P40048 NEJ1YLR265C 1029 nt13.1□□□□□ -0.31
PTP3P40048 PEX34YCL056C 435 nt13.1□□□□□ -0.31
PTP3P40048 RSA3YLR221C 663 nt13.08□□□□□ -0.32
PTP3P40048 PAU5YFL020C 369 nt13.07□□□□□ -0.32
PTP3P40048 POM34YLR018C 900 nt13.07□□□□□ -0.32
PTP3P40048 PGC1YPL206C 966 nt13.07□□□□□ -0.32
PTP3P40048 GND1YHR183W 1470 nt13.06□□□□□ -0.32
PTP3P40048 NBP35YGL091C 987 nt13.06□□□□□ -0.32
PTP3P40048 AME1YBR211C 975 nt13.06□□□□□ -0.32
PTP3P40048 APT2YDR441C 546 nt13.05□□□□□ -0.32
PTP3P40048 GET2YER083C 858 nt13.05□□□□□ -0.32
PTP3P40048 MET28YIR017C 564 nt13.05□□□□□ -0.32
PTP3P40048 YJL064WYJL064W 396 nt13.05□□□□□ -0.32
PTP3P40048 BOP3YNL042W 1191 nt13.05□□□□□ -0.32
PTP3P40048 PCH2YBR186W 1695 nt13.05□□□□□ -0.32
PTP3P40048 YDL158CYDL158C 309 nt13.02□□□□□ -0.33
PTP3P40048 YGR011WYGR011W 327 nt13.02□□□□□ -0.33
PTP3P40048 RMA1YKL132C 1293 nt13.01□□□□□ -0.33
PTP3P40048 TIF6YPR016C 738 nt13.01□□□□□ -0.33
PTP3P40048 SLX1YBR228W 915 nt13.01□□□□□ -0.33
PTP3P40048 SLG1YOR008C 1137 nt13□□□□□ -0.33
PTP3P40048 YBR232CYBR232C 360 nt13□□□□□ -0.33
PTP3P40048 AGP1YCL025C 1902 nt13□□□□□ -0.33
PTP3P40048 PRO1YDR300C 1287 nt12.99□□□□□ -0.33
PTP3P40048 SIR2YDL042C 1689 nt12.97□□□□□ -0.33
PTP3P40048 TIM44YIL022W 1296 nt12.97□□□□□ -0.33
PTP3P40048 YML089CYML089C 369 nt12.97□□□□□ -0.33
PTP3P40048 MMS21YEL019C 804 nt12.96□□□□□ -0.33
PTP3P40048 YMR074CYMR074C 438 nt12.96□□□□□ -0.33
PTP3P40048 PUS9YDL036C 1389 nt12.95□□□□□ -0.34
PTP3P40048 PAU19YMR325W 375 nt12.95□□□□□ -0.34
PTP3P40048 NDJ1YOL104C 1059 nt12.95□□□□□ -0.34
PTP3P40048 TAF4YMR005W 1167 nt12.94□□□□□ -0.34
PTP3P40048 SUT2YPR009W 807 nt12.94□□□□□ -0.34
PTP3P40048 RTF1YGL244W 1677 nt12.93□□□□□ -0.34
PTP3P40048 YNL165WYNL165W 1221 nt12.93□□□□□ -0.34
PTP3P40048 YOL107WYOL107W 1029 nt12.93□□□□□ -0.34
PTP3P40048 PZF1YPR186C 1290 nt12.93□□□□□ -0.34
PTP3P40048 ATG15YCR068W 1563 nt12.93□□□□□ -0.34
PTP3P40048 GUT2YIL155C 1950 nt12.92□□□□□ -0.34
PTP3P40048 MRS3YJL133W 945 nt12.92□□□□□ -0.34
PTP3P40048 RIB2YOL066C 1776 nt12.92□□□□□ -0.34
PTP3P40048 FIT3YOR383C 615 nt12.91□□□□□ -0.34
PTP3P40048 PRM4YPL156C 855 nt12.91□□□□□ -0.34
PTP3P40048 COA2YPL189C-A 207 nt12.91□□□□□ -0.34
PTP3P40048 ERG6YML008C 1152 nt12.9□□□□□ -0.34
PTP3P40048 STP3YLR375W 1032 nt12.89□□□□□ -0.35
PTP3P40048 RIB1YBL033C 1038 nt12.89□□□□□ -0.35
PTP3P40048 GAT1YFL021W 1533 nt12.88□□□□□ -0.35
PTP3P40048 ECM9YKR004C 1134 nt12.88□□□□□ -0.35
PTP3P40048 MSA2YKR077W 1092 nt12.88□□□□□ -0.35
PTP3P40048 SMM1YNR015W 1155 nt12.88□□□□□ -0.35
PTP3P40048 CSI1YMR025W 888 nt12.86□□□□□ -0.35
PTP3P40048 TIF34YMR146C 1044 nt12.86□□□□□ -0.35
PTP3P40048 ZTA1YBR046C 1005 nt12.86□□□□□ -0.35
PTP3P40048 MRI1YPR118W 1236 nt12.86□□□□□ -0.35
PTP3P40048 LIP2YLR239C 987 nt12.85□□□□□ -0.35
PTP3P40048 ALG7YBR243C 1347 nt12.85□□□□□ -0.35
PTP3P40048 LSB3YFR024C-A 1380 nt12.84□□□□□ -0.35
PTP3P40048 PCL10YGL134W 1302 nt12.84□□□□□ -0.35
PTP3P40048 BDF1YLR399C 2061 nt12.83□□□□□ -0.36
PTP3P40048 YER147C-AYER147C-A 411 nt12.82□□□□□ -0.36
PTP3P40048 LSC2YGR244C 1284 nt12.82□□□□□ -0.36
PTP3P40048 SOD2YHR008C 702 nt12.81□□□□□ -0.36
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