Protein–RNA interactions for Protein: P39905

GDNF, Glial cell line-derived neurotrophic factor, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDNFP39905 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GDNFP39905 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GDNFP39905 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GDNFP39905 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GDNFP39905 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GDNFP39905 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GDNFP39905 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GDNFP39905 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GDNFP39905 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GDNFP39905 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GDNFP39905 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GDNFP39905 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GDNFP39905 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GDNFP39905 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GDNFP39905 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GDNFP39905 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GDNFP39905 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GDNFP39905 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GDNFP39905 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GDNFP39905 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GDNFP39905 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GDNFP39905 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GDNFP39905 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GDNFP39905 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GDNFP39905 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GDNFP39905 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GDNFP39905 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GDNFP39905 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GDNFP39905 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GDNFP39905 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GDNFP39905 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GDNFP39905 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GDNFP39905 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GDNFP39905 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GDNFP39905 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GDNFP39905 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GDNFP39905 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GDNFP39905 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GDNFP39905 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GDNFP39905 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GDNFP39905 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GDNFP39905 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GDNFP39905 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GDNFP39905 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GDNFP39905 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GDNFP39905 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GDNFP39905 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GDNFP39905 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GDNFP39905 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GDNFP39905 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GDNFP39905 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GDNFP39905 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GDNFP39905 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GDNFP39905 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GDNFP39905 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDNFP39905 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDNFP39905 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDNFP39905 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDNFP39905 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GDNFP39905 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GDNFP39905 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GDNFP39905 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GDNFP39905 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDNFP39905 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GDNFP39905 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GDNFP39905 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GDNFP39905 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GDNFP39905 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GDNFP39905 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GDNFP39905 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GDNFP39905 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GDNFP39905 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GDNFP39905 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GDNFP39905 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GDNFP39905 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GDNFP39905 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GDNFP39905 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GDNFP39905 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GDNFP39905 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GDNFP39905 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GDNFP39905 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GDNFP39905 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GDNFP39905 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GDNFP39905 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GDNFP39905 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GDNFP39905 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDNFP39905 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDNFP39905 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GDNFP39905 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
GDNFP39905 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
GDNFP39905 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
GDNFP39905 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDNFP39905 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDNFP39905 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDNFP39905 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDNFP39905 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDNFP39905 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDNFP39905 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDNFP39905 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDNFP39905 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 672.6 ms