Protein–RNA interactions for Protein: P39087

Grik2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik2P39087 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Grik2P39087 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Grik2P39087 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Grik2P39087 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Grik2P39087 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Grik2P39087 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Grik2P39087 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Grik2P39087 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Grik2P39087 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Grik2P39087 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Grik2P39087 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Grik2P39087 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Grik2P39087 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Grik2P39087 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Grik2P39087 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Grik2P39087 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Grik2P39087 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Grik2P39087 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Grik2P39087 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Grik2P39087 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Grik2P39087 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Grik2P39087 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Grik2P39087 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Grik2P39087 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Grik2P39087 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Grik2P39087 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Grik2P39087 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Grik2P39087 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Grik2P39087 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Grik2P39087 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Grik2P39087 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Grik2P39087 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Grik2P39087 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Grik2P39087 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Grik2P39087 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Grik2P39087 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Grik2P39087 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Grik2P39087 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Grik2P39087 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Grik2P39087 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Grik2P39087 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Grik2P39087 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Grik2P39087 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Grik2P39087 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Grik2P39087 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Grik2P39087 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Grik2P39087 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Grik2P39087 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Grik2P39087 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Grik2P39087 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Grik2P39087 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Grik2P39087 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Grik2P39087 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Grik2P39087 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Grik2P39087 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Grik2P39087 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Grik2P39087 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Grik2P39087 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Grik2P39087 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Grik2P39087 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Grik2P39087 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Grik2P39087 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Grik2P39087 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Grik2P39087 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Grik2P39087 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Grik2P39087 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Grik2P39087 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Grik2P39087 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Grik2P39087 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Grik2P39087 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Grik2P39087 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Grik2P39087 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Grik2P39087 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Grik2P39087 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Grik2P39087 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Grik2P39087 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Grik2P39087 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Grik2P39087 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Grik2P39087 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Grik2P39087 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Grik2P39087 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Grik2P39087 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Grik2P39087 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Grik2P39087 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Grik2P39087 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Grik2P39087 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Grik2P39087 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Grik2P39087 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Grik2P39087 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Grik2P39087 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Grik2P39087 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Grik2P39087 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Grik2P39087 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Grik2P39087 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Grik2P39087 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Grik2P39087 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Grik2P39087 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Grik2P39087 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Grik2P39087 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Grik2P39087 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms