Protein–RNA interactions for Protein: P39086

GRIK1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK1P39086 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GRIK1P39086 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GRIK1P39086 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GRIK1P39086 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GRIK1P39086 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GRIK1P39086 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GRIK1P39086 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GRIK1P39086 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GRIK1P39086 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
GRIK1P39086 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GRIK1P39086 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GRIK1P39086 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GRIK1P39086 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GRIK1P39086 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GRIK1P39086 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GRIK1P39086 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GRIK1P39086 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GRIK1P39086 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GRIK1P39086 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GRIK1P39086 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GRIK1P39086 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GRIK1P39086 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GRIK1P39086 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GRIK1P39086 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GRIK1P39086 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GRIK1P39086 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GRIK1P39086 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GRIK1P39086 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
GRIK1P39086 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GRIK1P39086 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GRIK1P39086 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GRIK1P39086 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GRIK1P39086 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GRIK1P39086 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GRIK1P39086 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GRIK1P39086 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GRIK1P39086 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GRIK1P39086 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GRIK1P39086 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GRIK1P39086 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GRIK1P39086 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GRIK1P39086 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GRIK1P39086 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GRIK1P39086 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GRIK1P39086 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GRIK1P39086 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GRIK1P39086 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GRIK1P39086 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GRIK1P39086 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GRIK1P39086 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GRIK1P39086 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GRIK1P39086 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
GRIK1P39086 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GRIK1P39086 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GRIK1P39086 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
GRIK1P39086 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GRIK1P39086 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GRIK1P39086 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GRIK1P39086 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
GRIK1P39086 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GRIK1P39086 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
GRIK1P39086 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
GRIK1P39086 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
GRIK1P39086 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
GRIK1P39086 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28■■■□□ 2.07
GRIK1P39086 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
GRIK1P39086 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GRIK1P39086 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GRIK1P39086 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GRIK1P39086 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GRIK1P39086 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GRIK1P39086 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GRIK1P39086 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GRIK1P39086 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GRIK1P39086 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GRIK1P39086 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GRIK1P39086 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GRIK1P39086 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GRIK1P39086 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GRIK1P39086 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GRIK1P39086 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GRIK1P39086 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
GRIK1P39086 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GRIK1P39086 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GRIK1P39086 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GRIK1P39086 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GRIK1P39086 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GRIK1P39086 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GRIK1P39086 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GRIK1P39086 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GRIK1P39086 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GRIK1P39086 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GRIK1P39086 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GRIK1P39086 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GRIK1P39086 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GRIK1P39086 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GRIK1P39086 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GRIK1P39086 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GRIK1P39086 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GRIK1P39086 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms