Protein–RNA interactions for Protein: P39039

Mbl1, Mannose-binding protein A, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbl1P39039 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mbl1P39039 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mbl1P39039 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mbl1P39039 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mbl1P39039 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mbl1P39039 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mbl1P39039 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mbl1P39039 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mbl1P39039 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mbl1P39039 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mbl1P39039 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Mbl1P39039 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mbl1P39039 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mbl1P39039 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mbl1P39039 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mbl1P39039 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mbl1P39039 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mbl1P39039 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mbl1P39039 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mbl1P39039 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mbl1P39039 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mbl1P39039 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mbl1P39039 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mbl1P39039 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mbl1P39039 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mbl1P39039 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mbl1P39039 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mbl1P39039 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mbl1P39039 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mbl1P39039 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mbl1P39039 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mbl1P39039 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Mbl1P39039 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mbl1P39039 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mbl1P39039 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mbl1P39039 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mbl1P39039 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mbl1P39039 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mbl1P39039 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mbl1P39039 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mbl1P39039 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mbl1P39039 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mbl1P39039 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Mbl1P39039 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mbl1P39039 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Mbl1P39039 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mbl1P39039 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mbl1P39039 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mbl1P39039 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mbl1P39039 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mbl1P39039 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mbl1P39039 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mbl1P39039 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mbl1P39039 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mbl1P39039 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mbl1P39039 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mbl1P39039 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mbl1P39039 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mbl1P39039 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mbl1P39039 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mbl1P39039 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mbl1P39039 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Mbl1P39039 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mbl1P39039 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mbl1P39039 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mbl1P39039 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mbl1P39039 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mbl1P39039 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mbl1P39039 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mbl1P39039 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mbl1P39039 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mbl1P39039 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mbl1P39039 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mbl1P39039 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mbl1P39039 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mbl1P39039 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mbl1P39039 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mbl1P39039 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mbl1P39039 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mbl1P39039 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mbl1P39039 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mbl1P39039 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mbl1P39039 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mbl1P39039 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mbl1P39039 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mbl1P39039 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Mbl1P39039 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Mbl1P39039 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mbl1P39039 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mbl1P39039 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mbl1P39039 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mbl1P39039 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mbl1P39039 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mbl1P39039 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mbl1P39039 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mbl1P39039 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mbl1P39039 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mbl1P39039 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mbl1P39039 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mbl1P39039 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms