Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TtlP38585 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TtlP38585 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TtlP38585 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TtlP38585 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TtlP38585 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TtlP38585 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TtlP38585 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TtlP38585 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TtlP38585 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TtlP38585 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TtlP38585 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TtlP38585 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TtlP38585 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TtlP38585 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TtlP38585 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TtlP38585 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TtlP38585 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TtlP38585 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TtlP38585 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TtlP38585 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TtlP38585 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TtlP38585 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TtlP38585 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TtlP38585 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
TtlP38585 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TtlP38585 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TtlP38585 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TtlP38585 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TtlP38585 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TtlP38585 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TtlP38585 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TtlP38585 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TtlP38585 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TtlP38585 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TtlP38585 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TtlP38585 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TtlP38585 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TtlP38585 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TtlP38585 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TtlP38585 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TtlP38585 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TtlP38585 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TtlP38585 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TtlP38585 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TtlP38585 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TtlP38585 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TtlP38585 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TtlP38585 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TtlP38585 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TtlP38585 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TtlP38585 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TtlP38585 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TtlP38585 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TtlP38585 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TtlP38585 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TtlP38585 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TtlP38585 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TtlP38585 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TtlP38585 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TtlP38585 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TtlP38585 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TtlP38585 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TtlP38585 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TtlP38585 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TtlP38585 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TtlP38585 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TtlP38585 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TtlP38585 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TtlP38585 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TtlP38585 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TtlP38585 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TtlP38585 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TtlP38585 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TtlP38585 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TtlP38585 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TtlP38585 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TtlP38585 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TtlP38585 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TtlP38585 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TtlP38585 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TtlP38585 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TtlP38585 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TtlP38585 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TtlP38585 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TtlP38585 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TtlP38585 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TtlP38585 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TtlP38585 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TtlP38585 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TtlP38585 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TtlP38585 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TtlP38585 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TtlP38585 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TtlP38585 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TtlP38585 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TtlP38585 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TtlP38585 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TtlP38585 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TtlP38585 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.8 ms