Protein–RNA interactions for Protein: P37242

Thrb, Thyroid hormone receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThrbP37242 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ThrbP37242 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ThrbP37242 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ThrbP37242 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ThrbP37242 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ThrbP37242 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ThrbP37242 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ThrbP37242 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ThrbP37242 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ThrbP37242 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ThrbP37242 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ThrbP37242 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ThrbP37242 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ThrbP37242 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ThrbP37242 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ThrbP37242 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ThrbP37242 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ThrbP37242 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ThrbP37242 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ThrbP37242 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ThrbP37242 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ThrbP37242 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ThrbP37242 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ThrbP37242 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ThrbP37242 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ThrbP37242 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ThrbP37242 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ThrbP37242 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ThrbP37242 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ThrbP37242 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ThrbP37242 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ThrbP37242 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ThrbP37242 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ThrbP37242 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ThrbP37242 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ThrbP37242 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ThrbP37242 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ThrbP37242 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ThrbP37242 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ThrbP37242 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ThrbP37242 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ThrbP37242 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ThrbP37242 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ThrbP37242 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ThrbP37242 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ThrbP37242 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ThrbP37242 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ThrbP37242 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ThrbP37242 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ThrbP37242 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ThrbP37242 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ThrbP37242 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ThrbP37242 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ThrbP37242 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ThrbP37242 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ThrbP37242 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ThrbP37242 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ThrbP37242 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ThrbP37242 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ThrbP37242 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ThrbP37242 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ThrbP37242 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ThrbP37242 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ThrbP37242 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ThrbP37242 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ThrbP37242 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ThrbP37242 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ThrbP37242 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ThrbP37242 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ThrbP37242 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ThrbP37242 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ThrbP37242 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ThrbP37242 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ThrbP37242 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ThrbP37242 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ThrbP37242 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ThrbP37242 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ThrbP37242 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ThrbP37242 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ThrbP37242 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ThrbP37242 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ThrbP37242 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ThrbP37242 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ThrbP37242 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ThrbP37242 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ThrbP37242 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ThrbP37242 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ThrbP37242 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ThrbP37242 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ThrbP37242 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ThrbP37242 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ThrbP37242 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ThrbP37242 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ThrbP37242 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ThrbP37242 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ThrbP37242 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ThrbP37242 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ThrbP37242 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ThrbP37242 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ThrbP37242 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.8 ms