Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PPARGP37231 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PPARGP37231 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PPARGP37231 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PPARGP37231 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PPARGP37231 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PPARGP37231 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PPARGP37231 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PPARGP37231 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PPARGP37231 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PPARGP37231 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PPARGP37231 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PPARGP37231 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PPARGP37231 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PPARGP37231 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PPARGP37231 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PPARGP37231 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PPARGP37231 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
PPARGP37231 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
PPARGP37231 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PPARGP37231 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PPARGP37231 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PPARGP37231 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PPARGP37231 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PPARGP37231 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PPARGP37231 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PPARGP37231 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PPARGP37231 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PPARGP37231 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PPARGP37231 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PPARGP37231 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PPARGP37231 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PPARGP37231 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PPARGP37231 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PPARGP37231 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PPARGP37231 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PPARGP37231 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PPARGP37231 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PPARGP37231 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PPARGP37231 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PPARGP37231 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PPARGP37231 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PPARGP37231 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PPARGP37231 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PPARGP37231 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PPARGP37231 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PPARGP37231 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PPARGP37231 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PPARGP37231 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PPARGP37231 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PPARGP37231 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PPARGP37231 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PPARGP37231 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PPARGP37231 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PPARGP37231 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PPARGP37231 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PPARGP37231 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PPARGP37231 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PPARGP37231 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PPARGP37231 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PPARGP37231 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PPARGP37231 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PPARGP37231 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PPARGP37231 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PPARGP37231 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PPARGP37231 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PPARGP37231 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PPARGP37231 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PPARGP37231 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PPARGP37231 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PPARGP37231 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PPARGP37231 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PPARGP37231 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PPARGP37231 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PPARGP37231 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PPARGP37231 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PPARGP37231 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PPARGP37231 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PPARGP37231 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PPARGP37231 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PPARGP37231 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PPARGP37231 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PPARGP37231 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PPARGP37231 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PPARGP37231 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PPARGP37231 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
PPARGP37231 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PPARGP37231 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PPARGP37231 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PPARGP37231 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PPARGP37231 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PPARGP37231 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PPARGP37231 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PPARGP37231 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PPARGP37231 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PPARGP37231 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PPARGP37231 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PPARGP37231 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PPARGP37231 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PPARGP37231 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms