Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
GJC1P36383 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GJC1P36383 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GJC1P36383 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GJC1P36383 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GJC1P36383 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GJC1P36383 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GJC1P36383 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GJC1P36383 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GJC1P36383 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GJC1P36383 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GJC1P36383 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GJC1P36383 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
GJC1P36383 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GJC1P36383 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GJC1P36383 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
GJC1P36383 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
GJC1P36383 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GJC1P36383 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GJC1P36383 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GJC1P36383 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GJC1P36383 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GJC1P36383 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GJC1P36383 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GJC1P36383 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GJC1P36383 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GJC1P36383 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GJC1P36383 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GJC1P36383 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GJC1P36383 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GJC1P36383 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GJC1P36383 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GJC1P36383 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GJC1P36383 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GJC1P36383 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GJC1P36383 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GJC1P36383 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GJC1P36383 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
GJC1P36383 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GJC1P36383 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GJC1P36383 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GJC1P36383 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GJC1P36383 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GJC1P36383 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GJC1P36383 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GJC1P36383 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GJC1P36383 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GJC1P36383 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
GJC1P36383 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GJC1P36383 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GJC1P36383 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GJC1P36383 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GJC1P36383 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GJC1P36383 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GJC1P36383 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GJC1P36383 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GJC1P36383 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GJC1P36383 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GJC1P36383 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GJC1P36383 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GJC1P36383 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GJC1P36383 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GJC1P36383 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GJC1P36383 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GJC1P36383 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GJC1P36383 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GJC1P36383 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
GJC1P36383 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GJC1P36383 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GJC1P36383 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GJC1P36383 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GJC1P36383 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
GJC1P36383 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
GJC1P36383 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GJC1P36383 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GJC1P36383 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GJC1P36383 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GJC1P36383 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GJC1P36383 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
GJC1P36383 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GJC1P36383 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GJC1P36383 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GJC1P36383 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GJC1P36383 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GJC1P36383 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GJC1P36383 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GJC1P36383 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GJC1P36383 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GJC1P36383 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GJC1P36383 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
GJC1P36383 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GJC1P36383 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GJC1P36383 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GJC1P36383 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GJC1P36383 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GJC1P36383 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GJC1P36383 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GJC1P36383 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
GJC1P36383 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
GJC1P36383 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms