Protein–RNA interactions for Protein: P35790

CHKA, Choline kinase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKAP35790 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CHKAP35790 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHKAP35790 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHKAP35790 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHKAP35790 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHKAP35790 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CHKAP35790 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CHKAP35790 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CHKAP35790 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CHKAP35790 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CHKAP35790 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CHKAP35790 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CHKAP35790 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHKAP35790 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CHKAP35790 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHKAP35790 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHKAP35790 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHKAP35790 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHKAP35790 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHKAP35790 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHKAP35790 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHKAP35790 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHKAP35790 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHKAP35790 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHKAP35790 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHKAP35790 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHKAP35790 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHKAP35790 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHKAP35790 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CHKAP35790 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHKAP35790 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHKAP35790 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CHKAP35790 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHKAP35790 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHKAP35790 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHKAP35790 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHKAP35790 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CHKAP35790 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CHKAP35790 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHKAP35790 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHKAP35790 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHKAP35790 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CHKAP35790 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHKAP35790 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHKAP35790 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHKAP35790 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHKAP35790 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHKAP35790 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHKAP35790 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHKAP35790 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CHKAP35790 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHKAP35790 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CHKAP35790 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHKAP35790 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHKAP35790 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHKAP35790 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHKAP35790 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHKAP35790 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHKAP35790 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHKAP35790 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHKAP35790 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHKAP35790 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHKAP35790 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHKAP35790 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHKAP35790 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHKAP35790 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHKAP35790 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHKAP35790 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHKAP35790 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHKAP35790 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHKAP35790 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHKAP35790 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHKAP35790 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CHKAP35790 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CHKAP35790 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHKAP35790 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHKAP35790 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHKAP35790 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHKAP35790 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHKAP35790 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHKAP35790 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHKAP35790 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHKAP35790 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CHKAP35790 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CHKAP35790 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHKAP35790 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHKAP35790 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHKAP35790 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHKAP35790 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHKAP35790 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHKAP35790 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHKAP35790 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHKAP35790 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHKAP35790 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHKAP35790 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHKAP35790 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CHKAP35790 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CHKAP35790 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CHKAP35790 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHKAP35790 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms