Protein–RNA interactions for Protein: P35441

Thbs1, Thrombospondin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs1P35441 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Thbs1P35441 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Thbs1P35441 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Thbs1P35441 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Thbs1P35441 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Thbs1P35441 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Thbs1P35441 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Thbs1P35441 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Thbs1P35441 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Thbs1P35441 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Thbs1P35441 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Thbs1P35441 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Thbs1P35441 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Thbs1P35441 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Thbs1P35441 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Thbs1P35441 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Thbs1P35441 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Thbs1P35441 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Thbs1P35441 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Thbs1P35441 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Thbs1P35441 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Thbs1P35441 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Thbs1P35441 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Thbs1P35441 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Thbs1P35441 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Thbs1P35441 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Thbs1P35441 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Thbs1P35441 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Thbs1P35441 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Thbs1P35441 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Thbs1P35441 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Thbs1P35441 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Thbs1P35441 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Thbs1P35441 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Thbs1P35441 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Thbs1P35441 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Thbs1P35441 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Thbs1P35441 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Thbs1P35441 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Thbs1P35441 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Thbs1P35441 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Thbs1P35441 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Thbs1P35441 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Thbs1P35441 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Thbs1P35441 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Thbs1P35441 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Thbs1P35441 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Thbs1P35441 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Thbs1P35441 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Thbs1P35441 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Thbs1P35441 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Thbs1P35441 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Thbs1P35441 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Thbs1P35441 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Thbs1P35441 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Thbs1P35441 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Thbs1P35441 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Thbs1P35441 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Thbs1P35441 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Thbs1P35441 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Thbs1P35441 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Thbs1P35441 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Thbs1P35441 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Thbs1P35441 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Thbs1P35441 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Thbs1P35441 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Thbs1P35441 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Thbs1P35441 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Thbs1P35441 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Thbs1P35441 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Thbs1P35441 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Thbs1P35441 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Thbs1P35441 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Thbs1P35441 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Thbs1P35441 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Thbs1P35441 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Thbs1P35441 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Thbs1P35441 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Thbs1P35441 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Thbs1P35441 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Thbs1P35441 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Thbs1P35441 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Thbs1P35441 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Thbs1P35441 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Thbs1P35441 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Thbs1P35441 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Thbs1P35441 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Thbs1P35441 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Thbs1P35441 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Thbs1P35441 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Thbs1P35441 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Thbs1P35441 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Thbs1P35441 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Thbs1P35441 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Thbs1P35441 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Thbs1P35441 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Thbs1P35441 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Thbs1P35441 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Thbs1P35441 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Thbs1P35441 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms