Protein–RNA interactions for Protein: P35282

Rab21, Ras-related protein Rab-21, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab21P35282 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rab21P35282 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rab21P35282 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rab21P35282 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rab21P35282 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rab21P35282 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rab21P35282 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rab21P35282 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rab21P35282 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rab21P35282 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rab21P35282 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rab21P35282 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rab21P35282 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rab21P35282 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rab21P35282 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rab21P35282 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Rab21P35282 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rab21P35282 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rab21P35282 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rab21P35282 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rab21P35282 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rab21P35282 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rab21P35282 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rab21P35282 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rab21P35282 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rab21P35282 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rab21P35282 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rab21P35282 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rab21P35282 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Rab21P35282 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rab21P35282 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rab21P35282 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rab21P35282 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rab21P35282 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rab21P35282 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rab21P35282 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rab21P35282 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rab21P35282 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rab21P35282 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rab21P35282 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rab21P35282 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Rab21P35282 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rab21P35282 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rab21P35282 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rab21P35282 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rab21P35282 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rab21P35282 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rab21P35282 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rab21P35282 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rab21P35282 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rab21P35282 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rab21P35282 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rab21P35282 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rab21P35282 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rab21P35282 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rab21P35282 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rab21P35282 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rab21P35282 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rab21P35282 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rab21P35282 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rab21P35282 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Rab21P35282 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rab21P35282 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rab21P35282 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rab21P35282 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rab21P35282 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rab21P35282 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rab21P35282 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rab21P35282 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Rab21P35282 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rab21P35282 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rab21P35282 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rab21P35282 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rab21P35282 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rab21P35282 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rab21P35282 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rab21P35282 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rab21P35282 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rab21P35282 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rab21P35282 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rab21P35282 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rab21P35282 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Rab21P35282 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rab21P35282 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rab21P35282 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rab21P35282 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rab21P35282 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rab21P35282 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rab21P35282 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Rab21P35282 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rab21P35282 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rab21P35282 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rab21P35282 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rab21P35282 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rab21P35282 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rab21P35282 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rab21P35282 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Rab21P35282 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Rab21P35282 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rab21P35282 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms