Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CTNNB1P35222 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CTNNB1P35222 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CTNNB1P35222 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CTNNB1P35222 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CTNNB1P35222 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CTNNB1P35222 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CTNNB1P35222 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CTNNB1P35222 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CTNNB1P35222 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CTNNB1P35222 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CTNNB1P35222 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CTNNB1P35222 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CTNNB1P35222 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CTNNB1P35222 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CTNNB1P35222 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CTNNB1P35222 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CTNNB1P35222 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
CTNNB1P35222 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
CTNNB1P35222 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
CTNNB1P35222 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CTNNB1P35222 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CTNNB1P35222 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CTNNB1P35222 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CTNNB1P35222 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CTNNB1P35222 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CTNNB1P35222 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CTNNB1P35222 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CTNNB1P35222 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CTNNB1P35222 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CTNNB1P35222 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CTNNB1P35222 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CTNNB1P35222 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CTNNB1P35222 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CTNNB1P35222 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CTNNB1P35222 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CTNNB1P35222 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CTNNB1P35222 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CTNNB1P35222 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CTNNB1P35222 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CTNNB1P35222 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CTNNB1P35222 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CTNNB1P35222 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CTNNB1P35222 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CTNNB1P35222 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CTNNB1P35222 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CTNNB1P35222 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CTNNB1P35222 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CTNNB1P35222 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CTNNB1P35222 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CTNNB1P35222 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CTNNB1P35222 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CTNNB1P35222 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CTNNB1P35222 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CTNNB1P35222 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CTNNB1P35222 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CTNNB1P35222 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CTNNB1P35222 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CTNNB1P35222 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
CTNNB1P35222 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CTNNB1P35222 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CTNNB1P35222 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CTNNB1P35222 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CTNNB1P35222 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CTNNB1P35222 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CTNNB1P35222 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CTNNB1P35222 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CTNNB1P35222 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CTNNB1P35222 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CTNNB1P35222 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CTNNB1P35222 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CTNNB1P35222 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CTNNB1P35222 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CTNNB1P35222 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CTNNB1P35222 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CTNNB1P35222 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CTNNB1P35222 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CTNNB1P35222 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CTNNB1P35222 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CTNNB1P35222 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CTNNB1P35222 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CTNNB1P35222 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CTNNB1P35222 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CTNNB1P35222 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CTNNB1P35222 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CTNNB1P35222 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CTNNB1P35222 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CTNNB1P35222 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CTNNB1P35222 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CTNNB1P35222 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
CTNNB1P35222 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
CTNNB1P35222 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
CTNNB1P35222 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
CTNNB1P35222 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
CTNNB1P35222 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
CTNNB1P35222 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
CTNNB1P35222 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
CTNNB1P35222 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
CTNNB1P35222 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CTNNB1P35222 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms