Protein–RNA interactions for Protein: P33241

LSP1, Lymphocyte-specific protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSP1P33241 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LSP1P33241 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LSP1P33241 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LSP1P33241 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LSP1P33241 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LSP1P33241 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LSP1P33241 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LSP1P33241 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
LSP1P33241 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LSP1P33241 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LSP1P33241 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LSP1P33241 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LSP1P33241 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LSP1P33241 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LSP1P33241 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LSP1P33241 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LSP1P33241 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LSP1P33241 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
LSP1P33241 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LSP1P33241 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LSP1P33241 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LSP1P33241 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LSP1P33241 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
LSP1P33241 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
LSP1P33241 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LSP1P33241 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LSP1P33241 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LSP1P33241 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LSP1P33241 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LSP1P33241 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LSP1P33241 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LSP1P33241 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LSP1P33241 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LSP1P33241 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LSP1P33241 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LSP1P33241 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LSP1P33241 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LSP1P33241 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LSP1P33241 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LSP1P33241 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LSP1P33241 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LSP1P33241 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LSP1P33241 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LSP1P33241 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LSP1P33241 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LSP1P33241 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LSP1P33241 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LSP1P33241 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LSP1P33241 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LSP1P33241 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LSP1P33241 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LSP1P33241 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LSP1P33241 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
LSP1P33241 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LSP1P33241 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LSP1P33241 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LSP1P33241 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LSP1P33241 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LSP1P33241 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LSP1P33241 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LSP1P33241 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LSP1P33241 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
LSP1P33241 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LSP1P33241 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LSP1P33241 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LSP1P33241 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LSP1P33241 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LSP1P33241 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LSP1P33241 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LSP1P33241 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LSP1P33241 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LSP1P33241 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LSP1P33241 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LSP1P33241 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
LSP1P33241 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LSP1P33241 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LSP1P33241 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LSP1P33241 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LSP1P33241 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LSP1P33241 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LSP1P33241 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LSP1P33241 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LSP1P33241 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LSP1P33241 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LSP1P33241 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LSP1P33241 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LSP1P33241 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LSP1P33241 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LSP1P33241 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LSP1P33241 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LSP1P33241 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LSP1P33241 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LSP1P33241 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LSP1P33241 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LSP1P33241 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LSP1P33241 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LSP1P33241 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LSP1P33241 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
LSP1P33241 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LSP1P33241 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms