Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Nedd1P33215 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Nedd1P33215 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Nedd1P33215 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Nedd1P33215 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Nedd1P33215 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Nedd1P33215 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Nedd1P33215 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Nedd1P33215 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Nedd1P33215 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Nedd1P33215 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Nedd1P33215 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Nedd1P33215 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Nedd1P33215 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Nedd1P33215 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Nedd1P33215 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Nedd1P33215 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Nedd1P33215 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Nedd1P33215 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Nedd1P33215 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Nedd1P33215 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Nedd1P33215 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Nedd1P33215 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Nedd1P33215 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Nedd1P33215 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Nedd1P33215 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Nedd1P33215 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Nedd1P33215 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Nedd1P33215 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Nedd1P33215 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Nedd1P33215 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Nedd1P33215 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Nedd1P33215 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Nedd1P33215 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Nedd1P33215 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nedd1P33215 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nedd1P33215 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Nedd1P33215 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Nedd1P33215 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Nedd1P33215 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Nedd1P33215 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Nedd1P33215 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Nedd1P33215 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Nedd1P33215 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nedd1P33215 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nedd1P33215 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nedd1P33215 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Nedd1P33215 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Nedd1P33215 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nedd1P33215 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nedd1P33215 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Nedd1P33215 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nedd1P33215 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nedd1P33215 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nedd1P33215 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Nedd1P33215 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nedd1P33215 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nedd1P33215 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Nedd1P33215 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nedd1P33215 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nedd1P33215 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nedd1P33215 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nedd1P33215 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nedd1P33215 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nedd1P33215 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nedd1P33215 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nedd1P33215 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nedd1P33215 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nedd1P33215 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nedd1P33215 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nedd1P33215 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nedd1P33215 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Nedd1P33215 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nedd1P33215 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nedd1P33215 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Nedd1P33215 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Nedd1P33215 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nedd1P33215 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nedd1P33215 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nedd1P33215 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nedd1P33215 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nedd1P33215 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nedd1P33215 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nedd1P33215 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Nedd1P33215 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Nedd1P33215 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nedd1P33215 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Nedd1P33215 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nedd1P33215 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nedd1P33215 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nedd1P33215 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nedd1P33215 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Nedd1P33215 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nedd1P33215 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nedd1P33215 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nedd1P33215 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Nedd1P33215 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nedd1P33215 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Nedd1P33215 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Nedd1P33215 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms