Protein–RNA interactions for Protein: P32242

OTX1, Homeobox protein OTX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX1P32242 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
OTX1P32242 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
OTX1P32242 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
OTX1P32242 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
OTX1P32242 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
OTX1P32242 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
OTX1P32242 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
OTX1P32242 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
OTX1P32242 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
OTX1P32242 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
OTX1P32242 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
OTX1P32242 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
OTX1P32242 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
OTX1P32242 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
OTX1P32242 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
OTX1P32242 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
OTX1P32242 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
OTX1P32242 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
OTX1P32242 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
OTX1P32242 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
OTX1P32242 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
OTX1P32242 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
OTX1P32242 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
OTX1P32242 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
OTX1P32242 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
OTX1P32242 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
OTX1P32242 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
OTX1P32242 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
OTX1P32242 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
OTX1P32242 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
OTX1P32242 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
OTX1P32242 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
OTX1P32242 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
OTX1P32242 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
OTX1P32242 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
OTX1P32242 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
OTX1P32242 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
OTX1P32242 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
OTX1P32242 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
OTX1P32242 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
OTX1P32242 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
OTX1P32242 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
OTX1P32242 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
OTX1P32242 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
OTX1P32242 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
OTX1P32242 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
OTX1P32242 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
OTX1P32242 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
OTX1P32242 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
OTX1P32242 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
OTX1P32242 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
OTX1P32242 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
OTX1P32242 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
OTX1P32242 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
OTX1P32242 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
OTX1P32242 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
OTX1P32242 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
OTX1P32242 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
OTX1P32242 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
OTX1P32242 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
OTX1P32242 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
OTX1P32242 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
OTX1P32242 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
OTX1P32242 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
OTX1P32242 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
OTX1P32242 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
OTX1P32242 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
OTX1P32242 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
OTX1P32242 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
OTX1P32242 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
OTX1P32242 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
OTX1P32242 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
OTX1P32242 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
OTX1P32242 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
OTX1P32242 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
OTX1P32242 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
OTX1P32242 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
OTX1P32242 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
OTX1P32242 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
OTX1P32242 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
OTX1P32242 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
OTX1P32242 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
OTX1P32242 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
OTX1P32242 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
OTX1P32242 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
OTX1P32242 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
OTX1P32242 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
OTX1P32242 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
OTX1P32242 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
OTX1P32242 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
OTX1P32242 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
OTX1P32242 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
OTX1P32242 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
OTX1P32242 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
OTX1P32242 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
OTX1P32242 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
OTX1P32242 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
OTX1P32242 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
OTX1P32242 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
OTX1P32242 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms