Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CDC27P30260 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
CDC27P30260 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
CDC27P30260 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
CDC27P30260 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CDC27P30260 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
CDC27P30260 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
CDC27P30260 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
CDC27P30260 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
CDC27P30260 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
CDC27P30260 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
CDC27P30260 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
CDC27P30260 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
CDC27P30260 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CDC27P30260 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CDC27P30260 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CDC27P30260 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CDC27P30260 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CDC27P30260 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CDC27P30260 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CDC27P30260 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC31.06■■■□□ 2.56
CDC27P30260 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
CDC27P30260 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
CDC27P30260 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CDC27P30260 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CDC27P30260 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC31.05■■■□□ 2.56
CDC27P30260 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CDC27P30260 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CDC27P30260 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CDC27P30260 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CDC27P30260 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
CDC27P30260 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CDC27P30260 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
CDC27P30260 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
CDC27P30260 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CDC27P30260 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
CDC27P30260 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
CDC27P30260 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CDC27P30260 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
CDC27P30260 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CDC27P30260 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CDC27P30260 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CDC27P30260 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CDC27P30260 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CDC27P30260 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CDC27P30260 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CDC27P30260 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
CDC27P30260 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC30.95■■■□□ 2.54
CDC27P30260 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
CDC27P30260 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CDC27P30260 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CDC27P30260 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CDC27P30260 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CDC27P30260 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CDC27P30260 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CDC27P30260 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CDC27P30260 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
CDC27P30260 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CDC27P30260 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CDC27P30260 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CDC27P30260 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CDC27P30260 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
CDC27P30260 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.53
CDC27P30260 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CDC27P30260 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CDC27P30260 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CDC27P30260 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CDC27P30260 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CDC27P30260 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CDC27P30260 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CDC27P30260 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CDC27P30260 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CDC27P30260 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CDC27P30260 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CDC27P30260 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CDC27P30260 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CDC27P30260 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CDC27P30260 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CDC27P30260 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CDC27P30260 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CDC27P30260 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CDC27P30260 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CDC27P30260 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CDC27P30260 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CDC27P30260 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CDC27P30260 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CDC27P30260 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
CDC27P30260 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
CDC27P30260 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
CDC27P30260 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CDC27P30260 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CDC27P30260 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CDC27P30260 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CDC27P30260 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
CDC27P30260 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC30.77■■■□□ 2.52
CDC27P30260 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
CDC27P30260 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.52
CDC27P30260 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
CDC27P30260 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
CDC27P30260 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms