Protein–RNA interactions for Protein: P30084

ECHS1, Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1P30084 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
ECHS1P30084 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
ECHS1P30084 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ECHS1P30084 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ECHS1P30084 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ECHS1P30084 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ECHS1P30084 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ECHS1P30084 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ECHS1P30084 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ECHS1P30084 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.54■■■□□ 2
ECHS1P30084 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ECHS1P30084 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ECHS1P30084 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ECHS1P30084 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ECHS1P30084 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.53■■■□□ 2
ECHS1P30084 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ECHS1P30084 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ECHS1P30084 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ECHS1P30084 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ECHS1P30084 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ECHS1P30084 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ECHS1P30084 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ECHS1P30084 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ECHS1P30084 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ECHS1P30084 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ECHS1P30084 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ECHS1P30084 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
ECHS1P30084 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ECHS1P30084 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ECHS1P30084 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ECHS1P30084 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ECHS1P30084 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ECHS1P30084 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ECHS1P30084 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ECHS1P30084 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ECHS1P30084 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ECHS1P30084 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ECHS1P30084 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ECHS1P30084 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ECHS1P30084 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ECHS1P30084 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ECHS1P30084 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ECHS1P30084 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ECHS1P30084 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ECHS1P30084 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ECHS1P30084 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ECHS1P30084 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ECHS1P30084 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ECHS1P30084 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ECHS1P30084 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ECHS1P30084 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ECHS1P30084 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ECHS1P30084 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ECHS1P30084 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ECHS1P30084 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ECHS1P30084 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ECHS1P30084 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ECHS1P30084 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ECHS1P30084 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
ECHS1P30084 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
ECHS1P30084 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ECHS1P30084 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ECHS1P30084 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ECHS1P30084 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ECHS1P30084 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ECHS1P30084 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ECHS1P30084 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ECHS1P30084 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ECHS1P30084 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
ECHS1P30084 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ECHS1P30084 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ECHS1P30084 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ECHS1P30084 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
ECHS1P30084 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ECHS1P30084 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ECHS1P30084 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ECHS1P30084 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ECHS1P30084 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ECHS1P30084 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ECHS1P30084 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ECHS1P30084 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ECHS1P30084 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ECHS1P30084 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ECHS1P30084 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
ECHS1P30084 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ECHS1P30084 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ECHS1P30084 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
ECHS1P30084 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ECHS1P30084 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ECHS1P30084 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ECHS1P30084 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ECHS1P30084 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ECHS1P30084 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ECHS1P30084 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ECHS1P30084 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ECHS1P30084 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ECHS1P30084 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ECHS1P30084 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ECHS1P30084 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ECHS1P30084 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms