Protein–RNA interactions for Protein: P30041

PRDX6, Peroxiredoxin-6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDX6P30041 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRDX6P30041 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRDX6P30041 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRDX6P30041 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRDX6P30041 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRDX6P30041 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PRDX6P30041 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRDX6P30041 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRDX6P30041 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRDX6P30041 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRDX6P30041 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRDX6P30041 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRDX6P30041 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRDX6P30041 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRDX6P30041 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRDX6P30041 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRDX6P30041 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRDX6P30041 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRDX6P30041 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRDX6P30041 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRDX6P30041 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRDX6P30041 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRDX6P30041 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRDX6P30041 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRDX6P30041 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRDX6P30041 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRDX6P30041 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRDX6P30041 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PRDX6P30041 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PRDX6P30041 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PRDX6P30041 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRDX6P30041 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRDX6P30041 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRDX6P30041 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRDX6P30041 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRDX6P30041 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRDX6P30041 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRDX6P30041 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRDX6P30041 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRDX6P30041 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRDX6P30041 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRDX6P30041 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRDX6P30041 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRDX6P30041 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRDX6P30041 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRDX6P30041 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRDX6P30041 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRDX6P30041 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRDX6P30041 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRDX6P30041 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRDX6P30041 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRDX6P30041 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRDX6P30041 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRDX6P30041 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRDX6P30041 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRDX6P30041 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRDX6P30041 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRDX6P30041 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRDX6P30041 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRDX6P30041 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRDX6P30041 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PRDX6P30041 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRDX6P30041 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRDX6P30041 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRDX6P30041 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PRDX6P30041 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRDX6P30041 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRDX6P30041 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRDX6P30041 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRDX6P30041 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PRDX6P30041 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRDX6P30041 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PRDX6P30041 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRDX6P30041 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRDX6P30041 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRDX6P30041 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRDX6P30041 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRDX6P30041 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRDX6P30041 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRDX6P30041 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRDX6P30041 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRDX6P30041 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRDX6P30041 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRDX6P30041 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PRDX6P30041 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRDX6P30041 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRDX6P30041 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRDX6P30041 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRDX6P30041 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRDX6P30041 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRDX6P30041 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRDX6P30041 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRDX6P30041 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRDX6P30041 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRDX6P30041 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRDX6P30041 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRDX6P30041 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRDX6P30041 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRDX6P30041 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRDX6P30041 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms