Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VtnP29788 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VtnP29788 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VtnP29788 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VtnP29788 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VtnP29788 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VtnP29788 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VtnP29788 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VtnP29788 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VtnP29788 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VtnP29788 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VtnP29788 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VtnP29788 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VtnP29788 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VtnP29788 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VtnP29788 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VtnP29788 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VtnP29788 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VtnP29788 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VtnP29788 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VtnP29788 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VtnP29788 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VtnP29788 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
VtnP29788 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VtnP29788 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VtnP29788 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
VtnP29788 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
VtnP29788 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
VtnP29788 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VtnP29788 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VtnP29788 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VtnP29788 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VtnP29788 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VtnP29788 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VtnP29788 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VtnP29788 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VtnP29788 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VtnP29788 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VtnP29788 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VtnP29788 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VtnP29788 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VtnP29788 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VtnP29788 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VtnP29788 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VtnP29788 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VtnP29788 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
VtnP29788 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VtnP29788 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VtnP29788 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VtnP29788 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VtnP29788 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VtnP29788 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
VtnP29788 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VtnP29788 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VtnP29788 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VtnP29788 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VtnP29788 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VtnP29788 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VtnP29788 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VtnP29788 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
VtnP29788 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VtnP29788 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
VtnP29788 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VtnP29788 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VtnP29788 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VtnP29788 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VtnP29788 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VtnP29788 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
VtnP29788 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VtnP29788 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VtnP29788 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VtnP29788 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VtnP29788 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VtnP29788 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
VtnP29788 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VtnP29788 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VtnP29788 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VtnP29788 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VtnP29788 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VtnP29788 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VtnP29788 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VtnP29788 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VtnP29788 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VtnP29788 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VtnP29788 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VtnP29788 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
VtnP29788 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VtnP29788 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VtnP29788 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VtnP29788 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VtnP29788 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
VtnP29788 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VtnP29788 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VtnP29788 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VtnP29788 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VtnP29788 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VtnP29788 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VtnP29788 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VtnP29788 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VtnP29788 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.6 ms