Protein–RNA interactions for Protein: P29558

RBMS1, RNA-binding motif, single-stranded-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBMS1P29558 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RBMS1P29558 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RBMS1P29558 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RBMS1P29558 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RBMS1P29558 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RBMS1P29558 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RBMS1P29558 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RBMS1P29558 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RBMS1P29558 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RBMS1P29558 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RBMS1P29558 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RBMS1P29558 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RBMS1P29558 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
RBMS1P29558 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
RBMS1P29558 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RBMS1P29558 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
RBMS1P29558 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RBMS1P29558 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RBMS1P29558 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RBMS1P29558 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RBMS1P29558 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RBMS1P29558 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RBMS1P29558 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RBMS1P29558 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
RBMS1P29558 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RBMS1P29558 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RBMS1P29558 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RBMS1P29558 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RBMS1P29558 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RBMS1P29558 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RBMS1P29558 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RBMS1P29558 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RBMS1P29558 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RBMS1P29558 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RBMS1P29558 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RBMS1P29558 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
RBMS1P29558 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
RBMS1P29558 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
RBMS1P29558 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
RBMS1P29558 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RBMS1P29558 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RBMS1P29558 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RBMS1P29558 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RBMS1P29558 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RBMS1P29558 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RBMS1P29558 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RBMS1P29558 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RBMS1P29558 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RBMS1P29558 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RBMS1P29558 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RBMS1P29558 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RBMS1P29558 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RBMS1P29558 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RBMS1P29558 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
RBMS1P29558 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBMS1P29558 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBMS1P29558 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBMS1P29558 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBMS1P29558 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBMS1P29558 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RBMS1P29558 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RBMS1P29558 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RBMS1P29558 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RBMS1P29558 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RBMS1P29558 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RBMS1P29558 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RBMS1P29558 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBMS1P29558 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RBMS1P29558 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RBMS1P29558 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RBMS1P29558 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RBMS1P29558 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RBMS1P29558 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RBMS1P29558 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RBMS1P29558 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RBMS1P29558 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RBMS1P29558 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RBMS1P29558 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RBMS1P29558 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RBMS1P29558 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RBMS1P29558 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RBMS1P29558 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RBMS1P29558 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RBMS1P29558 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RBMS1P29558 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RBMS1P29558 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RBMS1P29558 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RBMS1P29558 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RBMS1P29558 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RBMS1P29558 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RBMS1P29558 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RBMS1P29558 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RBMS1P29558 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RBMS1P29558 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RBMS1P29558 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RBMS1P29558 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RBMS1P29558 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RBMS1P29558 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RBMS1P29558 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RBMS1P29558 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms