Protein–RNA interactions for Protein: P29016

CD1B, T-cell surface glycoprotein CD1b, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD1BP29016 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CD1BP29016 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CD1BP29016 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CD1BP29016 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CD1BP29016 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CD1BP29016 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CD1BP29016 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CD1BP29016 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CD1BP29016 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CD1BP29016 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CD1BP29016 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CD1BP29016 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CD1BP29016 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CD1BP29016 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CD1BP29016 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CD1BP29016 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CD1BP29016 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CD1BP29016 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CD1BP29016 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CD1BP29016 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CD1BP29016 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CD1BP29016 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CD1BP29016 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CD1BP29016 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CD1BP29016 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CD1BP29016 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CD1BP29016 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CD1BP29016 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CD1BP29016 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CD1BP29016 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CD1BP29016 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CD1BP29016 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CD1BP29016 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CD1BP29016 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CD1BP29016 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CD1BP29016 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CD1BP29016 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CD1BP29016 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CD1BP29016 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CD1BP29016 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CD1BP29016 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CD1BP29016 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD1BP29016 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD1BP29016 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD1BP29016 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD1BP29016 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD1BP29016 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD1BP29016 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD1BP29016 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CD1BP29016 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CD1BP29016 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CD1BP29016 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CD1BP29016 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CD1BP29016 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD1BP29016 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD1BP29016 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD1BP29016 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD1BP29016 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD1BP29016 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD1BP29016 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD1BP29016 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD1BP29016 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD1BP29016 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CD1BP29016 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD1BP29016 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD1BP29016 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD1BP29016 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD1BP29016 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD1BP29016 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD1BP29016 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD1BP29016 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD1BP29016 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD1BP29016 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD1BP29016 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CD1BP29016 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD1BP29016 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD1BP29016 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD1BP29016 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD1BP29016 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD1BP29016 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD1BP29016 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD1BP29016 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD1BP29016 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD1BP29016 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD1BP29016 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD1BP29016 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD1BP29016 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD1BP29016 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD1BP29016 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD1BP29016 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD1BP29016 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD1BP29016 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD1BP29016 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD1BP29016 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD1BP29016 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD1BP29016 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD1BP29016 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD1BP29016 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD1BP29016 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD1BP29016 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms