Protein–RNA interactions for Protein: P28329

CHAT, Choline O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHATP28329 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHATP28329 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHATP28329 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHATP28329 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHATP28329 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHATP28329 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHATP28329 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHATP28329 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHATP28329 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHATP28329 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHATP28329 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHATP28329 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHATP28329 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHATP28329 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHATP28329 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHATP28329 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHATP28329 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHATP28329 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHATP28329 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHATP28329 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CHATP28329 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHATP28329 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHATP28329 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHATP28329 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHATP28329 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHATP28329 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHATP28329 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHATP28329 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHATP28329 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHATP28329 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHATP28329 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHATP28329 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHATP28329 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHATP28329 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHATP28329 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHATP28329 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHATP28329 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHATP28329 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHATP28329 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHATP28329 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHATP28329 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHATP28329 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHATP28329 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHATP28329 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHATP28329 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHATP28329 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHATP28329 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHATP28329 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHATP28329 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHATP28329 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHATP28329 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHATP28329 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHATP28329 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHATP28329 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHATP28329 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CHATP28329 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHATP28329 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHATP28329 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHATP28329 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHATP28329 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHATP28329 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHATP28329 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHATP28329 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHATP28329 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHATP28329 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHATP28329 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHATP28329 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHATP28329 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHATP28329 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHATP28329 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHATP28329 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHATP28329 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHATP28329 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHATP28329 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHATP28329 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHATP28329 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CHATP28329 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHATP28329 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHATP28329 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHATP28329 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHATP28329 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHATP28329 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHATP28329 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHATP28329 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHATP28329 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHATP28329 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHATP28329 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHATP28329 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHATP28329 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHATP28329 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHATP28329 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHATP28329 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHATP28329 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHATP28329 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHATP28329 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHATP28329 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHATP28329 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHATP28329 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHATP28329 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHATP28329 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms