Protein–RNA interactions for Protein: P26998

CRYBB3, Beta-crystallin B3, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRYBB3P26998 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CRYBB3P26998 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CRYBB3P26998 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CRYBB3P26998 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CRYBB3P26998 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CRYBB3P26998 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CRYBB3P26998 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CRYBB3P26998 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CRYBB3P26998 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CRYBB3P26998 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CRYBB3P26998 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CRYBB3P26998 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CRYBB3P26998 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CRYBB3P26998 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CRYBB3P26998 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CRYBB3P26998 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CRYBB3P26998 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CRYBB3P26998 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CRYBB3P26998 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CRYBB3P26998 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CRYBB3P26998 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CRYBB3P26998 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CRYBB3P26998 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CRYBB3P26998 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CRYBB3P26998 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CRYBB3P26998 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CRYBB3P26998 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CRYBB3P26998 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CRYBB3P26998 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CRYBB3P26998 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CRYBB3P26998 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CRYBB3P26998 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CRYBB3P26998 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CRYBB3P26998 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CRYBB3P26998 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CRYBB3P26998 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CRYBB3P26998 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CRYBB3P26998 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
CRYBB3P26998 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CRYBB3P26998 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CRYBB3P26998 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CRYBB3P26998 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CRYBB3P26998 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CRYBB3P26998 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CRYBB3P26998 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CRYBB3P26998 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CRYBB3P26998 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CRYBB3P26998 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CRYBB3P26998 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CRYBB3P26998 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CRYBB3P26998 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CRYBB3P26998 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CRYBB3P26998 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CRYBB3P26998 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CRYBB3P26998 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CRYBB3P26998 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CRYBB3P26998 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CRYBB3P26998 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRYBB3P26998 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRYBB3P26998 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CRYBB3P26998 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CRYBB3P26998 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CRYBB3P26998 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CRYBB3P26998 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRYBB3P26998 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRYBB3P26998 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CRYBB3P26998 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CRYBB3P26998 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CRYBB3P26998 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CRYBB3P26998 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CRYBB3P26998 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CRYBB3P26998 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CRYBB3P26998 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CRYBB3P26998 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CRYBB3P26998 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CRYBB3P26998 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CRYBB3P26998 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CRYBB3P26998 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CRYBB3P26998 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CRYBB3P26998 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CRYBB3P26998 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CRYBB3P26998 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CRYBB3P26998 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CRYBB3P26998 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CRYBB3P26998 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CRYBB3P26998 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CRYBB3P26998 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CRYBB3P26998 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CRYBB3P26998 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CRYBB3P26998 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CRYBB3P26998 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CRYBB3P26998 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CRYBB3P26998 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CRYBB3P26998 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CRYBB3P26998 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CRYBB3P26998 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CRYBB3P26998 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CRYBB3P26998 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CRYBB3P26998 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CRYBB3P26998 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms