Protein–RNA interactions for Protein: P26951

IL3RA, Interleukin-3 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3RAP26951 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IL3RAP26951 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IL3RAP26951 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
IL3RAP26951 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IL3RAP26951 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IL3RAP26951 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IL3RAP26951 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IL3RAP26951 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IL3RAP26951 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IL3RAP26951 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IL3RAP26951 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
IL3RAP26951 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
IL3RAP26951 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IL3RAP26951 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IL3RAP26951 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IL3RAP26951 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IL3RAP26951 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
IL3RAP26951 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IL3RAP26951 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IL3RAP26951 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
IL3RAP26951 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
IL3RAP26951 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IL3RAP26951 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IL3RAP26951 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IL3RAP26951 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IL3RAP26951 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
IL3RAP26951 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
IL3RAP26951 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
IL3RAP26951 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
IL3RAP26951 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IL3RAP26951 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IL3RAP26951 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IL3RAP26951 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IL3RAP26951 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IL3RAP26951 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IL3RAP26951 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IL3RAP26951 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
IL3RAP26951 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IL3RAP26951 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IL3RAP26951 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IL3RAP26951 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IL3RAP26951 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IL3RAP26951 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IL3RAP26951 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IL3RAP26951 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IL3RAP26951 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IL3RAP26951 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IL3RAP26951 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IL3RAP26951 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IL3RAP26951 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IL3RAP26951 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IL3RAP26951 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IL3RAP26951 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IL3RAP26951 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IL3RAP26951 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
IL3RAP26951 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IL3RAP26951 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IL3RAP26951 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IL3RAP26951 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IL3RAP26951 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IL3RAP26951 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IL3RAP26951 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IL3RAP26951 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IL3RAP26951 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IL3RAP26951 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IL3RAP26951 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IL3RAP26951 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IL3RAP26951 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IL3RAP26951 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IL3RAP26951 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IL3RAP26951 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IL3RAP26951 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
IL3RAP26951 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IL3RAP26951 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IL3RAP26951 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IL3RAP26951 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IL3RAP26951 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IL3RAP26951 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IL3RAP26951 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IL3RAP26951 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
IL3RAP26951 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IL3RAP26951 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IL3RAP26951 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IL3RAP26951 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IL3RAP26951 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IL3RAP26951 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IL3RAP26951 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IL3RAP26951 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IL3RAP26951 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IL3RAP26951 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IL3RAP26951 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
IL3RAP26951 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
IL3RAP26951 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IL3RAP26951 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IL3RAP26951 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IL3RAP26951 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IL3RAP26951 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IL3RAP26951 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IL3RAP26951 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IL3RAP26951 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms