Protein–RNA interactions for Protein: P25233

Ndn, Necdin, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdnP25233 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NdnP25233 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NdnP25233 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NdnP25233 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NdnP25233 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NdnP25233 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NdnP25233 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NdnP25233 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NdnP25233 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NdnP25233 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NdnP25233 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NdnP25233 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NdnP25233 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NdnP25233 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NdnP25233 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NdnP25233 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NdnP25233 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NdnP25233 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NdnP25233 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NdnP25233 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NdnP25233 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NdnP25233 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NdnP25233 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NdnP25233 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NdnP25233 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NdnP25233 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NdnP25233 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NdnP25233 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NdnP25233 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NdnP25233 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NdnP25233 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NdnP25233 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NdnP25233 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NdnP25233 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
NdnP25233 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NdnP25233 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NdnP25233 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NdnP25233 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NdnP25233 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NdnP25233 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NdnP25233 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
NdnP25233 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NdnP25233 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NdnP25233 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NdnP25233 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NdnP25233 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NdnP25233 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NdnP25233 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NdnP25233 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NdnP25233 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NdnP25233 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NdnP25233 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NdnP25233 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
NdnP25233 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
NdnP25233 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NdnP25233 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NdnP25233 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NdnP25233 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
NdnP25233 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NdnP25233 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NdnP25233 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NdnP25233 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NdnP25233 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NdnP25233 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NdnP25233 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NdnP25233 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NdnP25233 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NdnP25233 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NdnP25233 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NdnP25233 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NdnP25233 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NdnP25233 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NdnP25233 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NdnP25233 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NdnP25233 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NdnP25233 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NdnP25233 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NdnP25233 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NdnP25233 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NdnP25233 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NdnP25233 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NdnP25233 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NdnP25233 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NdnP25233 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NdnP25233 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NdnP25233 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NdnP25233 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NdnP25233 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NdnP25233 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NdnP25233 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NdnP25233 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NdnP25233 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NdnP25233 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NdnP25233 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NdnP25233 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NdnP25233 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NdnP25233 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NdnP25233 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NdnP25233 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NdnP25233 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms