Protein–RNA interactions for Protein: P23299

Kcne1, Potassium voltage-gated channel subfamily E member 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcne1P23299 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kcne1P23299 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kcne1P23299 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kcne1P23299 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kcne1P23299 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kcne1P23299 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kcne1P23299 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kcne1P23299 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kcne1P23299 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kcne1P23299 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kcne1P23299 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Kcne1P23299 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kcne1P23299 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kcne1P23299 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kcne1P23299 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kcne1P23299 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kcne1P23299 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kcne1P23299 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kcne1P23299 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kcne1P23299 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kcne1P23299 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kcne1P23299 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kcne1P23299 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kcne1P23299 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kcne1P23299 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Kcne1P23299 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kcne1P23299 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kcne1P23299 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kcne1P23299 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kcne1P23299 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kcne1P23299 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kcne1P23299 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kcne1P23299 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kcne1P23299 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kcne1P23299 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kcne1P23299 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kcne1P23299 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kcne1P23299 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kcne1P23299 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kcne1P23299 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kcne1P23299 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kcne1P23299 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kcne1P23299 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Kcne1P23299 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Kcne1P23299 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Kcne1P23299 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kcne1P23299 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Kcne1P23299 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kcne1P23299 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kcne1P23299 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kcne1P23299 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kcne1P23299 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kcne1P23299 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kcne1P23299 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kcne1P23299 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Kcne1P23299 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kcne1P23299 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kcne1P23299 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcne1P23299 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcne1P23299 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcne1P23299 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kcne1P23299 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kcne1P23299 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kcne1P23299 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kcne1P23299 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kcne1P23299 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kcne1P23299 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kcne1P23299 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kcne1P23299 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kcne1P23299 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kcne1P23299 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kcne1P23299 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kcne1P23299 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcne1P23299 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kcne1P23299 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kcne1P23299 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kcne1P23299 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kcne1P23299 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Kcne1P23299 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kcne1P23299 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kcne1P23299 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kcne1P23299 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kcne1P23299 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kcne1P23299 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kcne1P23299 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kcne1P23299 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kcne1P23299 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kcne1P23299 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kcne1P23299 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kcne1P23299 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kcne1P23299 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kcne1P23299 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kcne1P23299 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kcne1P23299 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kcne1P23299 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kcne1P23299 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kcne1P23299 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kcne1P23299 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kcne1P23299 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kcne1P23299 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms